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hsa_circ_087631在原发性胆汁性胆管炎中的表达和作用机制*

2021-01-06张吟眉郝新杰郑佳佳

中国病理生理杂志 2020年12期
关键词:萤光免疫性质粒

张吟眉,郝新杰,郑佳佳

(北京大学第三医院检验科,北京 100191)

原发性胆汁性胆管炎(primary biliary cholangi⁃tis,PBC)是一种渐进性发展的慢性自身免疫性胆汁淤积性肝病,以淋巴细胞性胆管炎,肝内小胆管逐渐破坏,导致纤维化为主要特征,并可能通过并发症导致肝硬化[1]。PBC 发病机制复杂,目前临床尚缺乏PBC 早期诊断理想的分子标志物以及监测PBC 疾病进展以及治疗效果的有效指标[2-3]。

环状RNA(circular RNA,circRNA)是一类共价闭合的非编码RNA 分子,具有较高的核糖核酸酶R(ribonuclease R,RNase R)抗性和较长的半衰期,并以组织和发育阶段特异性方式表达[4-5]。circRNA 具有生物调控功能,可以作为微小RNA(microRNA,miRNA,miR)的分子海绵以调控miRNA 对靶基因表达的干预,是一种潜在的理想的疾病诊断标志物和治疗靶标[6-7]。我们前期分析了PBC 患者circRNA 表达谱芯片,发现22 条差异表达的circRNA,hsa_circ_087631 是其中丰度较高且表达均一的circRNA 之一[8]。通过芯片生物信息学分析获得与circRNA 结合的miRNA,并对miRNA 靶基因进行预测,显示在hsa_circ_087631 与miR-346 上存在结合位点。为揭示hsa_circ_087631 和miR-346 是否参与PBC 的发病机制,我们观察了hsa_circ_087631 在PBC 患者中的表达,并初步探讨了其作用机制。

前期我们通过文献检索联合芯片和RT-qPCR 检测,证实了miR-346在PBC 患者外周血T淋巴细胞的表达显著低于健康对照组。有研究表明,滤泡辅助性T 细胞(follicular helper T cells,Tfh)和滤泡调节性T细胞(follicular regulatory T cells,Tfr)的比例失衡可以导致多种自身免疫性疾病[9-10]。本课题组的前期研究发现,PBC患者相对于健康者Tfh细胞比例显著升高,Tfr 细胞比例下降[11]。有文献报道,Tfh17 和Tfh2 能够通过分泌白细胞介素21(interleukin-21,IL-21)辅助B 细胞产生免疫球蛋白[12];又有文献表明,miR-346能通过抑制Bcl-6,调控自身免疫性疾病中循环CD4+CXCR5+Tfh 细胞的比例[13]。因此,我们试图研究在PBC 患者中是否存在hsa_circ_087631/miR-346/Bcl6 或hsa_circ_087631/miR-346/IL-21 的 信号转导,通过调控CD4+CXCR5+Tfh 细胞参与PBC 的进展,以及对预测的circRNA-miRNA-mRNA 通路的潜在功能进行探索,为探索PBC 新的靶向治疗方法提供依据。

材料和方法

1 队列收集

实验对象为2018 年~2019 年北京大学第三医院消化科门诊和住院PBC 患者30 例,以及性别、年龄匹配的健康对照者30 例。所有入组个体均进行肝功能、抗线粒体抗体(antimitochondrial antibodies,AMA)、免疫球蛋白及肝脏B 超检测,并排除HBV 和HCV 感染,队列的临床特征见表1。所有患者及健康对照者全部填写知情同意书。所有个体采集外周静脉抗凝血进行后续检测。

表1 PBC患者和健康对照者的临床特征Table 1.Clinical characteristics of PBC patients and healthy controls

2 主要试剂

TRIzol 和Lipofectamine 2000(Invitrogen);逆转录试剂盒、SYBR Green Mix、SDS loading buffer 和RNase free water(TaKaRa);DMEM/F12培养基、胎牛血清、Opti-MEM®I Reduced Serum Medium 和0.25%EDTA-胰蛋白酶(Gibco);Polyethylenimine MAX(Polysciences);双萤光素酶报告基因检测试剂盒(Promega);所用引物由上海生工公司合成,序列见表2。

表2 RT-qPCR引物序列Table 2.The sequences of the primers for RT-qPCR

3 主要方法

3.1 构建过表达hsa-miR-346 的慢病毒pLenti-EF1a-EGFP-F2A-Puro-CMV-MCS 将hsa-miR-346 模板DNA 定向插入慢病毒pLenti-EF1a-EGFP-F2A-Pu⁃ro-CMV-MCS 载体(记为H145)中,构建过表达hsamiR-346 的慢病毒 pLenti-EF1a-EGFP-F2A-Puro-CMV-MCS(记为H9113),并转染到293TN细胞中。

3.2 RT-qPCR 实验 采用TRIzol 法从细胞中提取总RNA,取1.0 μg 总RNA,用oligo(dT)和random primers 逆转录出cDNA 用于检测hsa-miR-346、hsa_circ_087631、Bcl-6 mRNA 和IL-21 mRNA 表达水平。以GAPDH 为内参照。在ABI PRISM®7500 Se⁃quence Detection System(Applied Biosystems)进行PCR和数据分析。以2−ΔΔCt法计算相对表达水平

3.3 双萤光素酶报告基因系统检测hsa_circ_087631 与hsa-miR-346 的结合 参照已报道方法构建包含hsa-miR-346 潜在结合序列的hsa_circ_087631 重组萤光素酶报告质粒pGL3-hsa_circ_087631-761-781 及包含突变了结合序列的重组质粒pGL3-hsa_circ_087631-761-781-Mut。将293T细胞按70%的汇合度接种到96 孔板,24 h 后转染萤光素酶报告基因质粒和miRNA,每个样品设置6 个复孔,转染48 h后,弃去培养基,用PBS缓冲液洗涤细胞1次。每孔加入50 μL 的1× Passive Lysis Buffer 裂解液,常温条件摇床晃动15 min;裂解液转移到白色不透光的96 孔酶标板中,加入100 μL 预先混好的LAR II,设置荧光发光仪程序,检测萤火虫萤光素酶的活性;向检测管中加入100 μL Stop&Glo®试剂,检测海肾萤光素酶活性。两种萤光素酶活性比值的变化可反映hsa_circRNA_08763与hsa-miR-346结合情况。

4 统计学处理

计量资料以均数±标准差(mean±SD)表示,用SPSS 20.0 统计软件进行分析。多组间均数比较采用单因素方差分析(one-way ANOVA),组间两两比较采用Bonferroni 校正的t检验。以P<0.05 为差异有统计学意义。

结 果

1 PBC患者外周血hsa_circ_087631水平显著升高

本研究选取30 例PBC 患者和30 例健康对照者血浆标本进行检测,结果显示,PBC 患者的hsa_circ_087631 水平与健康对照者相比显著升高(P<0.05),见图1。

Figure 1.The expression of hsa_circ_0087631 in the peripheral blood from PBC patients and healthy controls was de⁃tected by RT-qPCR.Mean±SD. n=30.*P<0.05 vs healthy control group.图1 PBC 患者和健康对照者外周血hsa_circ_0087631 表达水平的比较

2 hsa-miR-346 在Jurkat 细胞过表达后hsa_circ_0087631表达降低

通过芯片生物信息学分析,我们发现在PBC 外周血中高表达的hsa_circRNA_087631 与miR-346 存在结合位点。接下来我们验证两者是否存在调控作用。将目的基因hsa-miR-346 插入空载体pLenti-EF1a-EGFP-F2A-Puro-CMV-MCS(H145),成功构建hsa-miR-346 过表达的慢病毒pLenti-EF1a-EGFPF2A-Puro-CMV-MCS(H9113),见图2A。该慢病毒感染293TN 细胞的效果如2B 所示,H9113 能够稳定过表达hsa-miR-346,见图2C。将该慢病毒以MOI=60感染人急性T细胞白血病Jurkat细胞后,与空载体对照Jurkat-H145 组相比,转染H9113 的Jurkat-H9113 组中hsa-miR-346 的表达水平显著增高(P<0.01),而hsa_circ_087631 的表达水平降低(P<0.01),见图2D、E。

Figure 2.The expression of hsa_circ_0087631 was decreased after the hsa-miR-346-overexpressing lentiviral vector was transfected into the Jurkat cells.A:the structural diagram of blank vector pLenti-EF1a-EGFP-F2A-Puro-CMV-MCS(H145)and hsamiR-346-overexpressing lentiviral vector pLenti-EF1a-EGFP-F2A-Puro-CMV-MCS(H9113);B:the cell infection rate of H145 and H9113(48 h after transfection,×200);C:the expression of hsa-miR-346 in 293TN cells after transfection;D:the expression of hsa-miR-346 after the hsa-miR-346-overexpressing lentiviral vector H9113 was transfected into the Jurkat cells;E:the expression of hsa_circ_087631 after the hsa-miR-346-overexpressing lentiviral vector H9113 was transfected into the Jurkat cells.Mean±SD. n=3.##P<0.01 vs H145 group;**P<0.01 vs Jurkat-H145 group.图2 hsa-miR-346过表达慢病毒降低Jurkat细胞中hsa_circ_0087631表达

3 hsa-miR-346对Bcl-6和IL-21的调控

我们进一步验证miR-346 是否对下游靶基因Bcl-6和IL-21存在调控。将hsa-miR-346 过表达慢病毒质粒H9113 以MOI=60 感染Jurkat 细胞后,Jurkat-H9113 组Bcl-6 和IL-21 的mRNA 表达均显著降低(P<0.05),见图3。这提示hsa-miR-346 对下游基因Bcl-6和IL-21存在调控作用。

4 验证hsa_circ_0087631与hsa-miR-346的相互作用

我们通过双萤光素酶报告基因系统检测hsamiR-346和hsa_circ_087631是否存在相互作用,再结合定点突变技术确定miRNA 与靶基因的作用位点。构建hsa_circ_087631 野生型质粒(pMIR-REPORThsa_circ_087631 3´UTR-WT,H7168)和hsa_circ_087631 双突变质粒(pMIR-REPORT-hsa_circ_087631 3´UTR-Mut,H7169),其中hsa_circ_087631双突变位点针对生物信息学预测的hsa-miR-346 与hsa_circ_087631 结合的两个靶位点进行突变,见图4A。将H7168 及H7169 分别与hsa-miR-346 mimics共转染至293T 细胞,hsa-miR-346 可显著降低野生型hsa_circ_087631 的萤光素酶活性(P<0.01);而在结合位点突变后,这种调控关系仍然存在(P<0.01),见图4B。由此推测该miRNA 可能不是通过我们预测的结合位点调控了萤光素酶的表达。上述结果证实hsa_circ_087631 与hsa-miR-346 的确存在相互作用,hsa-miR-346 抑制了hsa_circ_087631 的表达,但结合位点需要进一步通过实验验证。

Figure 3.The mRNA expression of Bcl-6 and IL-21 after the hsa-miR-346-overexpressing lentiviral vector was transfected into the Jurkat cells.Mean±SD. n=3.*P<0.05 vs Jurcat-H145 group.图3 hsa-miR-346过表达对Jurkat细胞中Bcl-6和IL-21表达的影响

Figure 4.Dual-luciferase reporter assay was performed to identify the interactions between hsa_circ_087631 and hsa-miR-346.A:the schematic diagram of double mutant hsa_circ_087631 vector(H7169);B:relative luciferase activity in dual-luciferase reporter assay.Mean±SD. n=3.**P<0.01 vs H7168+NC group;##P<0.01 vs H7169+NC group.图4 双萤光素酶报告基因实验验证hsa_circ_0087631与hsa-miR-346的相互作用

讨 论

PBC 是一种慢性胆汁淤积性自身免疫性疾病,可进展为终末期肝病,其发病机制复杂,目前临床尚缺乏PBC 早期诊断理想的分子标志物以及监测PBC疾病进展和治疗效果的有效指标[15]。

circRNA 是一类具有调控基因表达作用的特殊的内源性非编码RNA,在进化上高度保守[5],与线性的mRNA 相比有更好的稳定性。circRNA 在外周血中稳定存在,参与免疫细胞发育和免疫调节的多个阶段,不仅可以作为诊断人类自身免疫性疾病的生物标志物,还可以代表疾病的活动性或严重程度。miRNA 是一种内源性的小分子非编码RNA,广泛参与生物体的生长、凋亡等的调控,与多种自身免疫性疾病的发展密切相关,circRNA 可通过作为miRNA的分子海绵调控许多生物学过程,包括DNA 甲基化、免疫反应和炎症反应,与多种自身免疫性疾病的相关[16-18]。

在前期工作中,我们通过比较PBC 患者及性别年龄匹配的健康对照者外周血血浆中circRNA 表达谱芯片分析以及聚类分析,发现了22 条差异表达的circRNA,其中hsa_circ_087631 是外周血中高表达的circRNA 之一。本研究中我们再次通过RT-qPCR 对芯片结果进行验证,结果证实hsa_circ_087631 在PBC 患者外周血中相对于健康对照者表达升高。将hsa-miR-346过表达慢病毒感染人急性T细胞白血病Jurkat 细胞后,hsa_circ_087631 表达降低,提示hsa_circ_0087631 可能通过调控hsa-miR-346 发挥作用。

Tfh 细胞作为新近发现的效应T 细胞亚群,辅助生发中心B 细胞产生抗体,其调节抗体生成的促生发中心反应可被Tfr 细胞抑制。多种自身免疫病的发生与Tfr 细胞分化不足、Tfh 数量增多及Tfr/Tfh 比值失衡有关[19-20]。本课题前期研究结果发现PBC 患者相对于健康者Tfh 细胞比例显著升高,Tfr 细胞比例下降,Tfr/Tfh比值显著降低[11]。

Chen(陈娟)等[13,21]报道了miR-346 对Bcl-6 有调控作用,而黄勇武等[22]的研究表明IL-21 可能通过调节Th17/Treg 平衡而参与了PBC 的发病机制。IL-21 可介导多种生物学效应的细胞因子,主要由活化的CD4+T 辅助细胞等合成和分泌,同时也可促进Tfh17 和Tfh2 分化、B 细胞转化为浆细胞以及免疫球蛋白的分泌,与多种自身免疫性疾病发病有关[22-23]。Bcl-6 主要表达于生发中心的B 细胞和CD4+T 细胞,参与调节T 细胞依赖的抗原反应。有研究显示miR-346 在PBC 患者外周血T 细胞中显著低于健康者,并可能参与了PBC 的发病过程[24],其机制可能是通过在转录水平和翻译水平抑制Bcl-6,从而调控自身免疫病中循环CD4+CXCR5+Tfh 细胞的表达情况[13]。本研究中,将hsa-miR-346 过表达慢病毒感染Jurkat细胞后,Bcl-6和IL-21的mRNA表达均显著降低。这提示在人T 细胞中可能存在hsa_circ_0087631/hsamiR-346/Bcl-6 或hsa_circ_0087631/hsa-miR-346/IL-21 功能关联的调控。hsa_circ_0087631 可能通过下调hsa-miR-346,调控下游靶基因Bcl-6和IL-21,上调Tfh细胞比例,从而在PBC的发病过程中发挥作用。

接下来,我们通过双萤光素酶报告基因系统研究hsa-miR-346 与hsa_circ_087631 的相互作用,并结合定点突变技术确定miRNA 与靶基因的作用位点。将野生型及双突变的hsa_circ_087631 质粒分别与hsa-miR-346 mimics 共转染至293T 细胞后,hsa-miR-346 可显著降低野生型hsa_circ_087631 的萤光素酶活性,而在结合位点突变后,这种调控关系仍然存在。上述实验结果证实了hsa-miR-346 与hsa_circ_087631 之间存在特异结合作用,但可能不是通过我们预测的结合位点调控萤光素酶的表达。在下一步的实验中,我们将应用多数据库,交叉预测hsa-miR-346 与hsa_circ_087631 之间的作用位点,继续探明hsa_circ_087631在PBC中作用的确切分子机制。

综上所述,本研究探索了参与自身免疫病理进程重要的Tfh 细胞相关的circRNA 在PBC 中的表达及其与上下游调控分子相互作用的机制。此类研究在国内外尚无报道,在相关研究领域属于首创,具有一定的创新性和科学价值,为探索PBC 新的靶向治疗方法提供理论依据。本研究也存在一定局限性,circRNA 可能影响的潜在下游靶基因对细胞功能的作用以及circRNA 与miR-346 的正确结合位点还有待进一步深入研究。

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