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海芦笋内生真菌基于PKS Ⅰ型功能基因的分离与鉴定

2014-02-13刘怡君王明洋辛志宏

食品科学 2014年11期

刘怡君,潘 沐,王明洋,王 惠,辛志宏

(南京农业大学食品科技学院,江苏 南京 210095)

植物内生菌为那些在生活史中的某一阶段生活在植物组织内、对植物组织没有引起明显病害症状的菌[1]。大量研究表明[2-3],植物内生菌能够产生结构新颖、活性独特的次级代谢产物,在生物制药、环境生态、农业生产等领域具有重要的应用价值,已经成为寻找和发现各种生物活性物质的重要资源。

在内生真菌的研究过程中,菌株来源和有效的筛选方法是决定能否发现新型生物活性物质的关键。常用的筛选方法是基于活性筛选和化学筛选或者二者的组合,这些方法在微生物次级代谢产物研究的过程中,曾经发挥过巨大的作用,筛选到许多盛产活性物质的菌株,但是随着研究的深入,这些筛选方法固有的缺陷也逐渐显现出来,最为突出的问题是在新化合物筛选的过程中,已知微生物和已知化合物不断被重复发现,大大增加了新化合物的发现难度,造成了巨大浪费,这已经成为植物内生真菌研究过程中的最主要的制约因素。

近年来,随着分子生物信息学的发展,部分微生物次级代谢产物合成酶系及其相关基因测序完成,生物合成机理越来越清晰,新的微生物筛选方法应运而生。

基于聚酮合成酶(polyketide synthase,PKS)功能基因定向筛选,目标直接指向合成聚酮化合物的目标基因,成为发现新型天然活性物质的重要策略之一,许多新发现的抑菌、抗肿瘤和抗病毒化合物都是由PKS合成的[4-6]。……

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