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基于AFLP分子标记的我国不同生态栽培产区枸杞资源遗传多样性分析

2023-09-13陆瑞华傅焕哲张文华陈占平赵玉玲钱大玮段金廒

中草药 2023年18期
关键词:分析

张 芳,陆瑞华,傅焕哲,张文华,李 重,任 钢,陈占平,赵玉玲,郭 盛,钱大玮,段金廒*

基于AFLP分子标记的我国不同生态栽培产区枸杞资源遗传多样性分析

张 芳1,陆瑞华1,傅焕哲1,张文华2,李 重2,任 钢3,陈占平3,赵玉玲4,郭 盛1,钱大玮1,段金廒1*

1. 南京中医药大学药学院,江苏省中药资源产业化过程协同创新中心/中药资源产业化与方剂创新药物国家地方联合工程研究中心,江苏 南京 210023 2. 宁夏百瑞源枸杞股份有限公司,宁夏 银川 750200 3. 青海省海西蒙古族藏族自治州农业科学研究所,青海 德令哈 817000 4. 新疆维吾尔自治区博尔塔拉蒙古自治州精河县枸杞产业发展中心,新疆 博尔塔拉 833399

利用荧光标记辅助的扩增片段长度多态性(amplified fragment length polymorphism,AFLP)技术,从基因组DNA水平上分析我国6个栽培生产区域52份枸杞样本的遗传多样性。对提取的枸杞DNA样本进行酶切、连接、预扩增和选扩增等步骤,扩增产物经毛细管电泳系统分离和数据采集后,利用Popgene软件计算遗传多样性参数,利用GenAlex软件计算遗传距离并进行主坐标分析,利用MEGA-X软件根据遗传距离进行聚类分析,利用Structure软件进行群体遗传结构分析。共筛选得到10对AFLP选择性扩增引物组合,扩增得到328条扩增片段,其中多态性片段121条,且在不同产地枸杞居群间多态性位点分布不均匀。分析显示不同栽培产区枸杞的遗传多样性较低,等位基因数(observed number of alleles,a)、有效等位基因数(effective number of alleles,e)、观测杂合度(Nei’s gene diversity,)和香浓信息指数(Shannon information index,)分别为1.438 0、1.231 6、0.140 7和0.215 2,Nei’s遗传相似性范围为0.835 4~0.890 2。不同栽培生产区域的枸杞居群间存在较为频繁的基因交流,遗传分化程度中等。……

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