罗汉果遗传多样性与群体结构及核心种质研究
2023-09-13莫长明谢文娟郭文锋张燕玲张馨丹马小军
莫长明,谢文娟,郭文锋,张燕玲,黄 江,张馨丹,李 忠,唐 其,马小军
• 药材与资源 •
罗汉果遗传多样性与群体结构及核心种质研究
莫长明1,谢文娟2#,郭文锋1,张燕玲3,黄 江2,张馨丹3,李 忠1,唐 其4*,马小军5*
1. 广西壮族自治区农业科学院广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室,广西 南宁 530007 2. 桂林医学院,广西 桂林 541001 3. 桂林吉福思罗汉果生物技术股份有限公司,广西 桂林 541006 4. 湖南农业大学园艺学院,湖南 长沙 410128 5. 中国医学科学院北京协和医学院 药用植物研究所,北京 100193
分析罗汉果种质遗传基础,以为其资源保护、品种改良和性状遗传结构解析提供依据。采用SSR荧光分子标记对325份罗汉果及其近缘物种资源进行亲缘关系鉴定,并且进一步分析罗汉果遗传多样性、群体结构和构建其核心种质。优选出的15对SSR荧光引物共检测到185个等位基因(平均为12.33个),平均香农信息指数(Shannon’s information index,)为1.67,多态性信息含量指数(polymorphism information content,PIC)≥0.54;325份种质亲缘关系聚类在遗传距离0.95附近被划分为赤瓟、翅子罗汉果和罗汉果3个亚群,其中罗汉果亚群发现大量几乎无遗传差异个体,共鉴别获得140份具遗传差异的罗汉果初级核心种质。这些初级核心种质遗传分化系数(genetic differentiation coefficient,FST)为0.140,群体间、群体内、个体内遗传变异分别占总变异的14.0%、19.0%和67.0%,野生、地方和栽培种平均遗传距离分别为0.802 1、0.576 8、0.422 0,分别为1.798、1.092、0.603;Jaccard遗传距离聚类分析在遗传距离0.8处被划分为9个亚群,群体结构和主成分分析均被划分为4个亚群。通过10%~70%比例随机抽样法,构建了32份核心种质,其采集地点占原始种质的94.12 %,等位基因数与原始种质的符合率为96.13%,值为1.944 9。……
