赵国连，王冀邯，崔晓利

(1． 西安市胸科医院 检验科，西安 710100 ；2.西北工业大学 医学研究院，西安 710072)

甲状腺癌(Thyroid cancer,THCA)是内分泌系中最常见的恶性肿瘤，易受饮食、遗传、环境等多种因素的影响[1]。近年来，中国的甲状腺癌的发病率呈上升趋势且女性高于男性[2]。基于甲状腺癌术前诊断率低且晚期患者预后差的特点，探索其发病机制并寻找新型分子标志物，对于早发现、早诊断、早治疗具有重要意义[3]。近年来，随着高通量测序技术及基因芯片技术的进步，其在生命科学领域的应用愈加广泛。利用生物信息学方法在庞大的基因数据库中筛选癌症诊断的生物标志物方法的有效性已经被大量的临床数据证实[4]。

目前已有学者[3]应用基因表达综合数据库(The gene expression omnibus,GEO)对甲状腺癌潜在的miRNAs 生物学标志物及靶基因功能和信号通路进行分析。Choi等通过肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)建立了一个12个基因预测模型(包括BCC8，CHI3L1，CLCNKA，FAM155B，GABRG1，LUM，MRO，MT1G，MT1H，SELV，SLC4A4和TMEM92)，用于预测甲状腺乳头状瘤(Papillary thyroid carcinoma,PTC)中的淋巴结转移[5]。此外，Lin等人使用肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)中与免疫相关的7个基因建立预后预测模型(包括AGTR1，CTGF，FAM3B，IL11，IL17C，PTH2R和SPAG11A)用于预测PTC预后情况[6]。因此，进一步探索公共数据库，将为寻找THCA发生发展的分子机制及挖掘疾病新型生物标志物提供依据。本研究整合了TCGA中的THCA基因表达数据，应用edgeR和limma两种算法对诊断甲状腺癌具有潜在应用价值的基因标志物做出预测，后续通过双聚类分析及ROC分析进一步验证预测基因的可靠性。通过生物信息学分析鉴定出了11个THCA的差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs)及与疾病诊断相关的基因，以期为探索THCA发生发展的分子机制及挖掘疾病新型生物标志物提供依据[2,7]。……