刘 阳，王丽茹，张 岩

(哈尔滨工业大学 生命科学与技术学院计算生物学研究中心,哈尔滨 150001)

结直肠癌(Colorectal cancer,CRC)是一种发生率极高的恶性肿瘤[1]。结肠腺癌(Colon adenocarcinoma,COAD)是结直肠癌最常见的病理类型之一(约占95%)[2]。然而目前现有的结肠腺癌的治疗手段(包括手术和化疗等综合治疗)仍然不能达到令人满意的效果，结肠腺癌的五年生存率依然不容乐观[3]。大部分患者发现和初诊为结肠腺癌时已处于癌症晚期，因此，现阶段的医疗诊治过程中晚就诊、缺乏可靠的生物标志物和不精准的治疗靶点已成为治疗结肠腺癌的主要障碍[4]，而早期诊断和治疗对于改善患者的预后和生活质量至关重要。最新的研究表明，除了遗传变异以外，扰乱的、不平衡的表观遗传基因组也是癌症发生发展的重要原因[5]。DNA甲基化是一种重要的调控基因表达的表观遗传修饰，与癌症的发生和发展紧密相关[6]。异常的DNA甲基化通过激活癌基因和/或使肿瘤抑制基因失活诱导癌症的发生发展[7]。通过因此本课题旨在通过结肠腺癌DNA甲基化谱，分析患者的DNA甲基化模式并识别出与预后相关的结肠腺癌亚型。

1 材料与方法

1.1 DNA甲基化数据的获取和预处理

从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas，TCGA，https://www.cancer.gov/about-nci/organization/ccg/research/structural-genomics/tcga)数据库中下载了结肠腺癌样本DNA甲基化数据和这些样本对应病人的临床信息，甲基化数据全部由Illumina Infinium HumanMethylation450 BeadChip芯片平台产生。选取324个记录了患者生存状态的结肠腺肿瘤样本数据进行接下来的分析。研究表明，发生在DNA启动子区的异常甲基化对癌症的发生发展起着重要调控作用。……