甲状腺乳头状癌潜在关键基因的生物信息学分析
2021-12-15赵珍邢琰张风华刘妍景尚华
赵珍,邢琰,张风华,刘妍,景尚华
(1.河北医科大学第四医院耳鼻咽喉-头颈外科,河北石家庄050000;2.河北省石家庄人民医院普通外科三病区,河北石家庄050000;3.河北省人民医院腺体外科,河北石家庄050000)
甲状腺癌是近年来增长最快的内分泌恶性肿瘤,发病率大于5%[1]。其中,80%~85%为甲状腺乳头状癌(papillary thyroid carcinoma,PTC)。PTC的治疗方式有手术切除,放射性碘消融等。尽管大多数PTC 患者预后良好,PTC 的5年总生存率为95%, 但仍有20%~30% 的患者会出现复发和进展[2]。
PTC 的形成是一个十分复杂的生物化学过程,其特征是各种分子的异常[3-4]。大规模基因组研究表明遗传改变在PTC 的发生发展中起着关键作用[5-7]。目前对其持续高发的原因尚未明确[8]。目前,我国多数地区将甲状腺超声筛查甲状腺癌作为常规体检项目。由于受检查医师主观认知水平限制较大,仍有很多的甲状腺癌误诊或漏诊,导致过度医疗和延误治疗。临床应用于诊疗PTC 的分子生物标志物在特异度和敏感度方面很低,对于临床的价值不大[9-11]。PTC 发病人数的迅速增长迫切需要开发新的有效的用于PTC 诊断和预后的分子标志物和治疗靶标。
本研究试图找到检测PTC 患者的新的高效的分子生物指标,使之能够提高临床的诊断和预后,成为潜在的治疗靶标。通过检测从Gene Expression Omnibus (GEO) 数据库(GSE60542,GSE33630 和GSE3467)中PTC 和正常甲状腺组织之间的差异表达基因,应用生物信息学方法分析基因的表达数据谱,对筛选出的基因进行基因本体论(gene ontology,GO)功能注释分析。建立蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI) 网络来鉴别与PTC 相关的关键基因。……
