单细胞测序技术在动脉粥样硬化研究中的研究进展
2021-12-05李晓辉综述司春婴关怀敏审校
医学研究生学报 2021年9期
关键词:小鼠
王 莉,李晓辉综述,司春婴,关怀敏审校
0 引 言
目前我国心血管病死亡占城乡居民总死亡原因的首位,心血管病患病率及死亡率仍处于上升阶段,心血管疾病的防治面临严峻形势[1]。动脉粥样硬化(atherosclerosis,AS)是心血管疾病的主要病理基础,临床上常导致心肌梗死、脑梗死等严重心脑血管病[2]。随着高通量测序技术尤其是单细胞基因组测序技术的建立和发展,对疾病的认识和基因组特征的分析进入单细胞水平。单细胞测序技术能够揭示单个细胞的基因结构和表达状态,是研究细胞异质性的有力工具。本文就单细胞测序技术在AS中的应用进展作一综述。
1 单细胞测序技术简介
1.1 单细胞测序技术的发展单细胞测序技术是在单个细胞水平上,对基因组、转录组、表观组进行高通量测序的新技术,是当前生物科研领域的焦点,其中应用最广泛的是单细胞转录组测序。在相似的细胞类型中,基因表达可能是异质的,常规转录组测序得到的是组织内基因的平均表达水平,掩盖了单个细胞之间存在的差异,而疾病的发生机制,却可能只与其中的某种细胞相关[3-4]。2009年,Tang等[5]首先报导应用了单细胞转录组测序方法,提出在样本材料有限的情况下,需要更灵敏的检测技术,单细胞测序应运而生。自2013年单细胞转录组制备系统Fluidigm C1面世以来,出现了多种检测技术平台,特别是2017年商业化的10×Genomics单细胞RNA测序(single cell RNA sequencing,scRNA-seq)技术出现,对于大量细胞的转录组定量更经济,系统稳定性更高,进一步降低了技术门槛,扩大了单细胞测序的应用范围[6-7]。……
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