HLA-DQB1*02:106鉴定和相关单体型分析及蛋白三级结构分析①
2021-11-25王天菊李恒新王满妮王小芳西安市中心血站HLA高分辨分型确认实验室西安710061
王天菊 齐 珺 李恒新 王满妮 王小芳 (西安市中心血站HLA高分辨分型确认实验室,西安710061)
人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)位于染色体6p21.3 区域,与机体自我识别和免疫应答密切相关,在人类遗传学、移植免疫学、输血医学等领域中发挥重要作用[1-5]。精准的HLA 分型技术促使越来越多的HLA 等位基因被发现和鉴定,为造血干细胞移植、疾病相关性研究、群体遗传学等提供数据支持。截至2020 年4 月,IMGT/HLA数据库 3.40 版(http://www. ebi. ac. uk/ipd/imgt/hla/stats)报道已发现的HLA 等位基因有27 258 个,其中HLA-DQB1等位基因有1 826个。HLA-DQB1位点属于HLA-Ⅱ类分子基因位点,与HLA-A/B/C/DRB1 位点相比,多态性较少,随着对HLA-DQB1 位点研究的逐渐深入,发现其与自身免疫性疾病、感染性疾病、肿瘤等有相关性。另外,HLA-DQB1抗原是移植免疫中最重要的抗原之一,2006 年HORN等[6]提出应将HLA-DQB1 分型列入造血干细胞移植前的组织配型实验中,其在造血干细胞移植中的作用也逐渐被认知和总结。
作者所在实验室应用聚合酶链反应-直接测序法(polymerase chain reaction-sequence based typing,PCR-SBT)和序列特异性寡核苷酸探针(polymerase chain reaction-sequence-specific oligonucleotide probes,PCR-SSOP)对临床异基因造血干细胞移植前HLA 高分辨确认分型时,发现HLA-DQB1 位点分型结果存在模棱两可,进一步采用基于Ion Torrent S5测序系统的下一代测序技术(next generation sequencing,NGS)进行鉴别,鉴定出一个罕见HLADQB1 等位基因 HLA-DQB1*02:106,通过对变异氨基酸在其三级结构中的位置比对和模拟分析,进一步分析变异氨基酸是否影响分子的高级结构。将罕见等位基因与经家系调查总结出其相应的HLAA/B/C/DRB1/DQB1 单体型,查询其在不同人种中的分布,现报告如下。
1 资料与方法
1.1 资料
1.1.1 样本来源 先证者为西安交通大学第一附属医院血液内科就诊的一名急性髓细胞白血病患者,陕西籍,汉族,女性,在本实验室HLA 高分辨分型中因HLA-DQB1 位点分型结果存在模棱两可而进一步确认。……
