蛋鸡繁殖性能相关长链非编码RNA的筛选与鉴定
2021-11-16段晓燕
家畜生态学报 2021年10期
刘 宇,段晓燕
(1.河北北方学院 实验动物中心,河北 张家口 075000;2河北北方学院 教务处,河北 张家口 075000)
随着测序技术的不断发展,大量哺乳动物基因组已经完成了测序并进行了组装。在哺乳动物基因组中,mRNA被认为是最重要的元件,但是其仅占基因组或转录组的一小部分,其余为非蛋白编码基因包括siRNAs、miRNAs、piRNAs以及lncRNA等等,这些非编码RNA也参与生命活动各个方面的调控过程[1-2]。
不同于小RNA分子,lncRNA是一种类似于mRNA长度大于200个碱基,在转录水平、转录后水平和染色体重塑等多种层面调控基因表达的的保守性较低的非蛋白编码RNA分子[3-4]。非编码RNA的作用包括且不仅限于X染色体失活、P53介导的细胞凋亡、癌细胞转移、诱导干细胞的重编程以及其他的一些过程[5-6]。随着第二代测序技术的发展以及lncRNA数据库的建立,为大规模筛选与性成熟调节过程相关的lncRNA提供了技术依据。
家禽的性成熟过程受到不同转录本构建的分子调控网络共同作用,而卵巢是一个独特又重要的生殖器官和内分泌腺,蛋鸡的卵巢发育程度直接关系着其产蛋性能的优劣,卵巢组织有关基因或非编码RNA表达的差异类型及其表达量的变化在分子水平上影响蛋鸡繁殖性能[7]。但相关研究,特别是关于lncRNA仍报道甚少。
本研究基于二代测序技术对不同产蛋阶段蛋鸡卵巢组织差异表达lncRNA进行筛选与鉴定,进一步挖掘影响蛋鸡繁殖性能的关键调节基因以及功能元件,研究成果有助于研究人员更好的理解蛋鸡性成熟过程中的分子调控机制,从而为蛋鸡育种工作服务。……
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