不同基因型鹅星状病毒鉴别诊断RT-PCR方法的建立
2021-11-10王宏宇朱寅初云涛华炯钢叶伟成倪征陈柳张存
王宏宇, 朱寅初, 云涛, 华炯钢, 叶伟成, 倪征, 陈柳, 张存
(1.浙江省农业科学院 畜牧兽医研究所,浙江 杭州 310021; 2.南京农业大学 动物医学院,江苏 南京 210095)
2014年在我国湖南首次报道发现鹅星状病毒(Goose astrovirus,GAstV),随后在辽宁、山东、江苏、安徽乃至广东等主要养鹅省份均陆续出现以内脏痛风为典型临床症状的传染病,经分离鉴定,病原为星状病毒,且基因组序列有别于湖南发现毒株[1-3]。当前证据显示,该病主要可导致5~20 d龄雏鹅发病,患病雏鹅表现为精神沉郁,卧地不动,采食下降甚至死亡,剖检可见心脏和肝脏表面明显的粉末状白色尿酸盐沉积,肾脏肿大坏死[4]。流行病学调查显示,近年来该病造成的死亡率由最初的5%逐渐上升,最高可达50%,给我国养鹅业带来严重危害,造成巨大经济损失[5]。
鹅星状病毒基因组分析显示,其为单股正链无囊膜RNA病毒,基因组全长约7~8 kb,两侧为5′UTR和3′UTR(具PolyA尾),包含ORF1a、ORF1b和ORF2 3个开放阅读框(ORF)[6-8]。ORF1a编码多种非机构蛋白;ORF1b序列与ORF1a存在重叠,编码保守的RNA依赖性RNA聚合酶(RbRp);ORF2为病毒结构蛋白,包裹病毒外表面,形成衣壳和纤突结构。随着越来越多病毒基因组的测序显示,已报道的鹅星状病毒存在两种基因型,核酸序列差异大,临床调查显示单一和混合病毒感染等多种情况均有出现;鉴于当前鹅星状病毒的致病机制尚不清楚,感染情况复杂,因而对该病毒的及时检测发现对后期防控尤为重要。在实际病原鉴定中针对一种基因型的鹅星状病毒的PCR检测不仅目标样本单一,而且……
