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遗忘型轻度认知功能损害血浆中竞争内源性RNA网络构建及分析

2021-11-02袁梦雅王静华

河北医科大学学报 2021年10期
关键词:血浆差异分析

张 微,洪 波,柳 安,袁梦雅,王静华,王 涛

(上海交通大学医学院附属精神卫生中心老年科,上海 200030)

人类基因组中约有80%的非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA),在基因表观遗传调控、转录和转录后加工中起着至关重要的作用[1],参与神经退行性疾病病理生理过程[2-3]。遗忘型轻度认知功能损害(amentia mild cognitive impairment,aMCI)被认为是阿尔茨海默病(Alzheimer′s disease,AD)早期认知障碍阶段[4]。本研究通过微阵列检测分析aMCI血浆中ncRNA差异表达,基于数据库构建了竞争内源性RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)网络,对网络中差异信使RNA(messenger RNA,mRNA)共表达基因进行了基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析,深入了解与aMCI相关的ncRNA有利于为AD开发潜在的新型生物标志物和治疗提供新策略[5]。

1 资料与方法

1.1一般资料 本研究选取来自中国纵向老龄化队列研究(CLAS,ClinicalTrials.gov标识符:NCT03672448)的受试者5例为aMCI组,同时选取5例正常人为正常对照组(normal control,NC)。两组性别、年龄和教育水平比较差异无统计学意义(P>0.05),具有可比性。

纳入标准:①认知能力在数月至数年中逐渐下降;②维持日常生活能力的独立性;③缺乏血管、外伤或其他医学原因导致认知能力下降的记忆障碍证据;④认知下降不足以满足AD的标准;⑤脑18F-Flutemetamol-PET扫描Aβ阳性。排除标准:①混合或血管性痴呆者;②其他疾病所致认知障碍或痴呆者。

所有受试者或其监护人均提供了书面知情同意书,本研究通过上海市精神中心伦理委员会的批准。

1.2血浆收集及RNA提取 收集受试者5 mL外周静脉血于乙二胺四乙酸二钾抗凝管中,4 ℃、3 000 r/min,分离心15 min后分离上层血浆。按照说明操作步骤采用TRIzol试剂(Invitrogen,美国)进行样品总RNA抽提,使用QIAGEN RNeasy Mini Kit(Qiagen,德国)纯化。R……

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