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深县猪全基因组选择信号检测分析

2021-10-21芦春莲贾梦雨任丽琴曹洪战

中国畜牧杂志 2021年10期
关键词:梅山信号研究

刘 刁,芦春莲,李 尚,贾梦雨,任丽琴,李 赛,曹洪战*

(1.河北农业大学动物科技学院,河北保定 071000;2.张家口市万全区水产技术推广站,河北张家口 0762503;3.河北正农牧业有限公司,河北辛集 052360)

我国地域辽阔,地形复杂,拥有丰富的猪遗传资源库。深县猪作为河北省现存的唯一地方黑猪,具有肉质好、耐粗饲、繁殖性能高等特点。为了更好地利用深县猪种质资源及对这一品种进行保护,我国学者和研究人员开展了一系列的遗传选育研究工作。例如,在选育过程中计算各世代的近交系数,结合仔猪生长性能和母猪繁殖性能的变异系数掌握近交程度,可以防止出现近交衰退,提高选育速度,加速深县猪遗传进展,使群体中的优良基因迅速纯合,并淘汰掉不利基因,从而达到亲本优良性状稳定遗传给下一代的选育效果[1];利用微卫星位点标记分析深县猪群体遗传多样性,并计算各家系在微卫星位点标记上的标准遗传距离,为分析育种改良潜力奠定基础[2-3]。随着单核苷酸多态性(SNP)芯片和全基因组重测序技术的快速发展,从分子层面揭示畜禽遗传多样性的研究日益普遍。有研究表明,中国南方猪与北方猪的表型特征也存在较大差异[4],同时与深县猪选择信号检测的相关研究相对匮乏,因此需要进一步研究。本文通过对深县猪进行全基因组选择信号分析,并与南方太湖猪的一个品系——梅山猪对比,探究深县猪的分子遗传特点,为深县猪的保种选育工作提供生物信息学参考。……

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