HBV-C基因型复制细胞系的构建与鉴定
2021-10-19李瑞明杨燕曾宪煌孟忠吉
李瑞明 杨燕 曾宪煌 孟忠吉
乙型肝炎病毒(hepatitis B virus, HBV)感染是导致慢性肝炎、肝硬化和肝细胞肝癌的重要原因之一[1-2]。核苷(酸)类似物[nucleos(t)ide analogues, NAs]广泛应用于乙型肝炎的治疗,大多数患者需要长期治疗甚至终身治疗,但是随着治疗时间的延长,产生HBV耐药性突变的风险会随之增加[3-5]。本研究旨在建立HBV临床分离株的体外复制稳定表达系统,研究其特征及其耐药机制,并针对不同患者体外筛选有效的抗HBV药物。
材料与方法
一、 实验材料
乙肝病毒全长基因组PCR扩增产物由本研究所从乙型肝炎患者血清中克隆扩增获得,在之前的文章中已经报道[6],参照Gunther等[7]设计引物及Durantel等[8]的HBV全长PCR参数,扩增出HBV全长基因组DNA。
质粒pcDNA3.0(-)-EGFP-ΔCMV由本研究所构建并保存,通过反向PCR删除了CMV启动子,并在转录终止序列BGH-pA的下游插入完整的绿色荧光蛋白(EGFP)表达框(图1);大肠杆菌DH5a感受态购自北京天根生化科技有限公司。
PCR扩增仪(美国Bio-Rad),酶标仪(德国Eppendorf),定量PCR仪(美国ABI stepone plus),Chamber Slides(美国Thermo Fisher Scientific);限制性内切酶T4 DNA连接酶购自New England Biolabs公司;高保真DNA聚合酶、DIG DNA Labeling and Detection Kit购自罗氏公司;DMEM培养基、脂质体Lipofectamine 2000、胎牛血清、G418(50 mg/mL)购自Invitrogen公司; DNA提取试剂盒、PCR产物纯化试剂盒、定量PCR试剂盒购自北京天根生化科技有限公司;HBsAg和HBeAg EILISA检测试剂盒购自科美公司;HBcAg和HBsAg抗体购自北京中杉金桥生物技术有限公司。
人肝癌细胞系HepG2和HepG2.2.15细胞系均为本室保存。
二、研究方法
(一) 引物设计 使用Vector Nti设计所需要引物,并由擎科生物公司合成。扩增0.2拷贝HBV 引物序列:pcDNA-232-HBV-2795-NotI-U tacggg-ccagatatacgcggccgcggatcctgcgcgggacgt,pcDNA-1255-HBV-169-SacI-D aagccatagagcccaccgagctcagatctcgaa-tagaaggaaaaaagtc。扩增1.0拷贝HBV引物序列:HBV-X15-BamHI-U cgcggatcctgcgcgggacgtcctttgtc-ta,HBV-X15-BamHI-D cgcggatccagttggcagcacaccc-tagcagc。
(二) 0.2拷贝及1.0拷贝HBV基因组的扩增 取2 μg HBV全长基因组PCR产物经SapI 37℃酶切4 h,纯化后取100 ng回收产物T4 DNA连接酶16℃过夜连接得到环状HBV全长基因组。……
