甜菜DAMD引物筛选及品种快速鉴定
2021-10-17丁刘慧子邳植吴则东
丁刘慧子,邳植,吴则东
(黑龙江大学现代农业与生态环境学院,哈尔滨 150080)
0 引言
糖甜菜是我国北方的重要经济作物和糖料作物,我国甜菜集中产区主要分布在内蒙古、黑龙江和新疆等地区[1]。甜菜在我国的栽培历史只有100 多年,甜菜制糖工业和种植业的发展,在很大程度上取决于甜菜品种的质量。目前我国的甜菜品种主要由世界上三大育种公司控制,国内使用的甜菜种子都依靠进口[2]。生产上偶尔会出现品种的假冒现象,而鉴别品种真实性的主要方法依然是形态学鉴定法。由于糖甜菜基本来源于白西里西亚这个品种[3],其遗传基础相对较窄,遗传差异较小,因此利用形态学方法对糖甜菜进行鉴定非常困难,而且鉴定过程往往需要经历整个甜菜生长期。
分子标记技术在20世纪80年代就已经开始应用,它是继形态学标记、细胞学标记和生化标记技术之后发展起来的一种新型的遗传标记[4]。近几十年以来,已经有SNP[5]、EST[6]、ISSR[7-8]、RFLP[9]、RAPD[10]、AFLP[11]、SRAP[12]和SSR[13-14]等多种分子标记技术被运用于甜菜遗传图谱的构建或遗传多样性分析。
DAMD 分子标记技术(Direct amplification of minisatellite region DNA)全称为基于聚合酶链式反应的小卫星DNA 定向扩增[15]。小卫星又称超可变重复序列(HVR)或可变数目串联重复序列(VNTR),是由10~60 bp碱基组成的串联重复序列,含有小卫星的区域通常表现出较高水平的限制性片段长度多态性(RFLP)。小卫星位点串联重复拷贝数中的极端变异被认为是人类观察到的多态性来源。由于小卫星或VNTR 序列广泛存在于不同种类的动植物中,以孟德尔的方式遗传,并具有较高的特异性,因此,可利用小卫星序列作为引物,采用PCR 技术扩增到小卫星之间的序列,用以区分不同的物种。……
