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甜菜BTB蛋白家族的挖掘与生物信息学分析

2021-10-17刘宇杨巧王晓丹赵春雷王希李彦丽贾海伦丁广洲陈丽

中国糖料 2021年4期
关键词:分析

刘宇,杨巧,王晓丹,赵春雷,王希,李彦丽,贾海伦,丁广洲,陈丽

(1.黑龙江大学现代农业与生态环境学院,哈尔滨 150080;2.黑龙江省甜菜工程技术研究中心,哈尔滨 150080;3.国家糖料改良中心,哈尔滨 150080;4.黑龙江省普通高等学校甜菜遗传育种重点实验室,哈尔滨 150080;5.国家甜菜种质中期库,哈尔滨 150080)

0 引言

世界糖产量每年约1.6亿t,其中甜菜糖占20%左右,人均食糖消费量约为23 kg,由于中国和印度等人口稠密国家生活水平的提高,每年用糖的需求量在不断增加。尽管甜菜是耐旱作物,但甜菜的生产区域正面向盐碱、干旱、冷凉地区扩展[1],面临着严重不利外界条件的影响,各种生物胁迫和非生物胁迫都会使甜菜减产。所以,挖掘甜菜的抗性基因非常重要,可以为甜菜的抗性育种提供理论依据。

植物基因组中有许多转录因子家族,它们一般通过结合靶基因的启动子激活或抑制其表达,在调节植物生长发育中发挥着重要的作用[2-3]。BTB(Broad-complex,tramtrack,and bric-à-brac)家族就是这样的一类转录因子,其特征是存在高度保守的BTB结构域,也被称为POZ(痘病毒锌指蛋白)结构域[4-5]。BTB蛋白一般由5 个α-螺旋(A1~A5)和3 个β-折叠(B1~B3)组成[6],这有利于BTB 蛋白与其它蛋白进行互作,如BTB 蛋白能够与E3 连接酶CULLIN3 相互作用,形成E3 泛素连接酶复合物的一部分参与目标蛋白的泛素化过程[7]。BTB蛋白家族除了包含BTB蛋白结构域外,还存在其他几种蛋白结构域,如锌指蛋白(TAZ)、Kelch、BTB和C端Kelch(BACK)、meprin and TRAFhomology(MATH)以及Ankyrin repeats(ANK),从而使BTB蛋白形成了不同亚家族,并发挥着不同的作用[4-5]。在这些亚家族中,BT-TAZ(BT)蛋白只存在于植物中,它的N 端是BTB 结构域,中心是TAZ结构域,C端是钙调素结合域(CaMBD)[8-9]。……

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