CXC亚家族趋化因子13在乳腺癌组织中表达及其调控网络的生物信息学分析
2021-09-18李英蕊李琴解军冯皓楠郭璇傅松涛
李英蕊,李琴,解军,冯皓楠,郭璇,傅松涛,4
1.山西医科大学基础医学院生物化学与分子生物学系,山西太原030000;
2.首都医科大学附属北京友谊医院肿瘤科,北京100021;
3.山西医科大学基础医学院病理学与病理生理学系,山西太原030000;
4.山西省生物医药健康研究生教育创新中心,山西太原030000
随着传统放化疗、内分泌治疗及靶向药物的应用,乳腺癌患者5年生存率得到极大提高,但乳腺癌发病率及死亡率仍在增长[1]。从分子水平研究乳腺癌机制,寻找新的治疗方法,是探索乳腺癌治疗的重要方向。肿瘤细胞的增殖、浸润由多种生长因子、趋化因子及细胞因子通过复杂的交互作用介导,其中趋化因子发挥重要的趋化作用,在多种炎症反应中激活特异性白细胞[2]。CXC亚家族趋化因子13(CXC subfamily chemokine 13,CXCL13)在肿瘤细胞生存及癌症转移中发挥重要的作用[3],CHU等[4]发现了两种对乳腺癌起关键作用的分子,CXCL13为其中之一。近来有研究表明,CXCL13可促进乳腺癌的进展及淋巴结转移[5-6]。
本文采用生物信息学方法分析CXCL13在乳腺癌组织中的表达及潜在的调控网络,为进一步探讨CXCL13在乳腺癌中的作用机制提供参考。
1 数据来源及分析
基于在线数据库分析乳腺癌组织中CXCL13。检索Oncomine数据库(https://www.oncomine.org/)分析CXCL13在乳腺癌组织中表达,获得CXCL13在多种乳腺癌组织中的转录水平数据,并对GLÜCK等[7]、CURTIS等[8]的研究结果及TCGA数据库中的乳腺癌组织转录组数据进行分析;检索c-BioPortal数据库(http://www.cbioportal.org/)分析乳腺癌样本中CXCL13基因的变化,对频率变化前50个CXCL13邻近基因用FunRich软件进行基……
