373例妇女下生殖道微生物宏基因组鸟枪法测序分析
2021-07-22陈宁陈晨王小雨陆瑞科高红琴李少华郝梨岚叶志强赵倩张韵红
中国计划生育和妇产科 2021年7期
关键词:研究
陈宁 ,陈晨,王小雨 ,陆瑞科,高红琴,李少华,郝梨岚,叶志强,赵倩,张韵红*
女性生殖道中栖息着庞大的菌群,对女性生殖道健康起着极重要的作用,国内外研究提示,菌群失衡与不孕、早产、宫颈癌等妇科疾病有密切关系。目前基于女性生殖道微生态系统研究多局限于16S rRNA基因高通量测序方法研究,使用16S rRNA基因扩增子测序的研究在分类学上存在对微生物种水平的分辨率较低和缺乏物种特异性功能推断能力的局限性[1]。宏基因组鸟枪法测序通过对微生物的全组DNA进行测序分析,可以充分发现宏基因组序列和功能差异信息,不但能了解微生物群体的多样性和丰度,还能发掘和研究具有特定功能的新基因[2]。本研究采用宏基因组鸟枪法测序,旨在探索女性生殖道微生物组和生殖道健康相关疾病的关系。
1 资料与方法
1.1 研究对象
招募苏州高新区2018年6~7月参与“两癌”筛查项目的女性,年龄35~65周岁,现场充分知情告知并签订知情同意书者入组,然后进行个人信息和样本采集,个人信息进行匿名处理。涉及临床诊断相关资料来自“两癌”筛查项目。资料和样本齐全纳入分析。
1.2 研究方法
1.2.1 样本采集和处理 医生在为入组志愿者进行妇科检查时,用无菌棉拭子在宫颈外口旋转10~20圈,蘸取足量分泌物,置于专用微生物保存液常温保存。两周之内寄往实验室-80℃冰箱保存待DNA提取。
1.2.2 微生物基因组总DNA提取及测序 采用美基生物通用型DNA抽提试剂盒(MagPure Universal DNA KF Kit)对样本的DNA进行提取,将提取好的DNA产物用赛默飞QubitTM双链DNA高灵敏度荧光定量试剂盒(Qubit dsDNA HS assay kit)进行定量。……
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