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外周血单个核细胞GPSM2水平可能是肝细胞癌预后判断的新型标志物*

2021-07-14杨永平

实用肝脏病杂志 2021年4期
关键词:关键数据库分析

于 哲,罗 婧,杨永平

肝癌是一种常见的消化系统恶性肿瘤,全球年新增肝癌病例达84.1万,死亡约78.2万,分别排在恶性肿瘤的第6位和第2位[1]。肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)这一病理学类型占肝癌总体近90%,即使在发达国家其5年生存率也低于20%。因此,对HCC的早期诊治尤为重要。目前,HCC的确诊、复查和预后判断仍依赖血清学、影像学和组织病理学检查。组织病理学检查存在有创性,血清学检查的有效性稍差,反复CT或MRI检查存在着放射性污染和费用贵的问题。因此,亟需更精准的无创性生物标记物用于HCC患者的诊断和预后判断。有研究报道,乳腺癌细胞可将外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cells,PBMC)募集到肿瘤部位,在肿瘤微环境中将其转化为促进肿瘤发展的免疫细胞,随后激活相关信号通路,改变PBMC的基因表达谱[2]。因此,PBMC基因水平差异的变化往往早于肿瘤周围的正常组织,提示通过检测PBMC基因有可能实现对肿瘤更精准的早期诊断或预后判断。多组学结合生物信息学工具的联合应用使我们有望找到HCC潜在的关键基因和治疗靶点。本研究通过挖掘公共数据库中HCC患者基因和临床数据,探索了HCC患者PBMC与肿瘤组织基因水平变化的相似性,以寻找有潜力的PBMC关键基因,研究关键基因在肿瘤发展过程中可能的作用及其与预后的关系,以期找到诊断HCC的新型标志物,为HCC的早期诊断和预后判断提供新指标。

1 资料与方法

1.1 数据检索 从NCBI-GEO数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)[3]检索数据集,纳入标准如下:①同时包含有HCC患者和健康人的PBMC资料数据;……

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