扁桃体癌患者人乳头瘤状病毒DNA整合位点分布分析
2021-07-09张欣欣陈南翔
魏 健,张欣欣,刘 坤,陈南翔
1 解放军总医院 耳鼻咽喉头颈外科医学部,北京 100853;2 国家耳鼻咽喉疾病临床医学研究中心,北京100853
全世界范围内约4.5%的肿瘤与人乳头瘤状病毒(human papilloma virus,HPV)相关[1-2]。近年来,越来越多的研究发现,口咽癌的发生与HPV感染相关[3-5]。最新版美国癌症联合会(American Joint Committee on Cancer,AJCC)肿瘤TNM分期已将HPV阳性口咽癌进行单独分期[6]。美国国家综合癌症网络(National Comprehensive Cancer Network,NCCN)头颈肿瘤临床指南更增加了针对HPV阳性口咽癌的规范化诊疗原则[7]。然而HPV对扁桃体癌的致癌机制尚不明确。在宫颈癌中,HPV的致癌作用已经被证实主要是通过其癌基因表达的相关癌蛋白E6和E7实现的[8-11]。Akagi等[12]提出了一种“环”模型,通过该模型,发现HPV整合引起的DNA复制和重组可能导致病毒-细胞DNA连接体形成,破坏了抑制肿瘤发生的基因,并扩增HPV癌基因E6和E7,从而导致基因组的不稳定。因此,病毒基因组整合是肿瘤发生过程中的关键一步。基于上述认知,本研究选择口咽癌中HPV感染率最高的扁桃体癌为研究对象。通过HPV基因捕获和二代测序技术,分析扁桃体癌患者HPV的感染情况以及HPV DNA整合到人类基因组中的位点,揭示HPV相关扁桃体癌的致病机制。
材料和方法
1 样本来源 收集2015年10月- 2020年7月解放军总医院耳鼻咽喉头颈外科收治的扁桃体鳞癌患者的临床资料,共收集32例样本,包括19例扁桃体癌新鲜冷冻标本和13例扁桃体癌石蜡包埋组织标本。本研究经过解放军总医院伦理委员会审批(伦审第S2019-056-01号)。
2 主要仪器与试剂 NanoDrop 1000分光光度计(v3.7.1)、全自动基因扩增仪(PCR System 9700)、Illumina HiSeq 2000测……
