CHST2在胶质瘤中的表达及临床意义
2021-07-02陈谦学
祝 斐 陈谦学
胶质瘤是最常见的原发性脑肿瘤,约占80%,其中胶质母细胞瘤(glioblastoma,GBM)的预后最差,中位生存时间12~15个月[1]。胶质瘤的发病机制极其复杂,深入了解胶质瘤发生、发展中的关键分子,对胶质瘤的诊治具有重要意义[2~4]。糖磺基转移酶2(carbohydrate sulfotransferase 2,CHST2)是糖6-O-磺基转移酶家族成员,与骨肉瘤的转移密切相关[5]。本文采用生信分析方法探讨CHST2在胶质瘤组织中表达变化及其意义。
1 资料与方法
1.1 数据检索 从Gliovis在线数据库中获取TCGA、CGGA和Rembrandt数据集(http://gliovis.bioinfo.cnio.es/)[6]。将获得的CHST2基因表达数据和对应的临床信息匹配,缺失预后信息的样本排除。利用TIMER在线网站分析CHST2和免疫浸润的相关性(https://cistrome.shinyapps.io/timer/)[7]。
1.2 统计学分析 采用Gr aphPad Pr i sm 8.0 软件进行分析,计量资料用±s表示,用t检验和单因素方差分析及Tukey检验;P<0.05 认为差异有统计学意义。
2 结果
2.1 CHST2的表达水平与胶质瘤病理特征的关系TCGA和CGGA数据集分析GBM和低级别胶质瘤(lower grade glioma,LGG)CHST2的表达水平,结果显示GBM组织CHST2表达水平显著高于LGG(P<0.05;图1A、1B)。异柠檬酸脱氢酶(isocitrate dehydrogenase,IDH)突变型胶质瘤CHST2表达水平明显低于IDH野生型胶质瘤(P<0.05;图1C、1D);1p19q缺失的胶质瘤CHST2表达水平明显低于未发生缺失的胶质瘤(P<0.05;图1E、1F)。间充质型GBM组织CHST2的表达水平明显高于前神经型、经典型GBM(P<0.05;图1G、1H)。
2.2 CHST2表达水平与胶质瘤预后的关系TCGA、CGGA和Rembrandt数据集分析CHST2与胶质瘤预后的关系,结果显示,胶质瘤、GBM和LGG病人,CHST2高表达组生存时间均显著低于低表达组(P<0.05;图2)。
2.3 CHST2表达水平与胶质瘤放、化疗反应的关系O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(O6-methylguanine-DNA methyltransferase,MGMT)启动子甲基化的GBM和LGG病人,CHST2过表达组生存时间较低表达组明显缩短(P<0.05;图3A、3F);但MGMT启动子未甲基化的GBM和LGG病人,CHST2的表达水平与病人生存时间没有明显关系(P>0.05;……
