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致病性大肠杆菌全基因组测序及毒力基因分析

2021-06-30王嘉福冉雪琴黄世会

工业微生物 2021年3期
关键词:小鼠

周 倩,王嘉福*,冉雪琴,牛 熙,黄世会

1.贵州大学生命科学学院,贵州贵阳 550025;2.贵州大学动物科学学院,贵州贵阳 550025

大肠杆菌存在于人和动物肠道中[1],某些大肠杆菌是导致仔猪腹泻的主要病原菌之一[2],其导致的疾病发病率高、发病急、死亡率高、涉及范围广,给养猪业造成巨大经济损失,严重影响了养猪业的发展[3]。然而由该菌引发的疾病目前缺少有效的治疗手段,临床上主要以母体抗原、抗血清、抗生素等为主,容易产生耐药性、药物残留等问题[4-5]。

大肠杆菌通过黏附素黏附于断奶仔猪小肠上皮细胞,就定居在小肠上并开始大量繁殖并产生毒素,产生的毒素被吸收后,引起胃肠道血管、皮下组织和脑血管的损伤,从而使宿主发生一系列疾病[6]。致病性大肠杆菌侵袭宿主组织引起其发病的过程是由多种毒力因子相互协调而发挥作用,大肠杆菌的主要毒力因子包括毒素、黏附素、外膜蛋白、铁转运系统和吸收系统等[7]。为研究致病性大肠杆菌致病力差异的原因,采用二代高通量测序技术对7株不同致病力的大肠杆菌进行全基因组测序,分析毒力基因的差异,以期解析大肠杆菌的致病因子和致病机制。

1 材料与方法

1.1 材料

菌株P211、P555、P32、P444和P111由本实验室从贵州某猪场腹泻仔猪粪样中分离,菌株S10670、E24190购自中国工业微生物菌种保藏管理中心。40只SPF级小鼠购自北京斯贝福生物技术有限公司。

1.2 菌株纯化鉴定

使用EMB、MAC和LB固体培养基对7菌株进行纯化,随后对菌株进行革兰……

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