赵尘培，姜琳琳，张建龙，陈国忠，于馨，朱洪伟，张兴晓

（鲁东大学生命科学学院，山东 烟台 264025）

乳酸菌（lactic acid bacteria，LAB）是一类能够发酵糖类物质最终产物为乳酸的革兰氏阳性细菌。在细菌分类学上将乳酸细菌分为43个属，包括373个种及亚种[1]。目前，在食品工业领域应用最多的乳酸菌主要有乳杆菌属、链球菌属、乳球菌属、肠球菌属、双歧杆菌属及片球菌属等。这些乳酸菌株可以定植在人和动物的肠道中，发挥免疫调节、抗氧化、降胆固醇及抑菌等功能。其中，乳酸菌在菌株水平上的分化是决定菌株功能差异性的重要因素。因此，在菌株水平上精确鉴定乳酸菌是非常重要的，可消除不同来源菌株对功能的影响。

随着分子生物技术的发展，基于聚合酶链反应（polymerase chain reaction,PCR）发展起来的许多分子分型方法被用于乳酸菌及其亚种的分类鉴定及种群遗传进化分析研究。例如，基于16S rDNA测序、脉冲场凝胶电泳（pulsed field gel electrophoresis,PFGE）、随机扩增多态性DNA（random amplified polymorphic DNA，RAPD）、限制性片段长度多态性（restriction fragment length polymorphism，RFLP）以及聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（cleaved amplification polymorphism sequence-tagged sites,CAPs）等技术，对乳酸菌株的特异性鉴定具有重要意义。其中，16SrDNA技术难以区分近缘种或亚种，而其它分子技术依赖于电泳图谱，对工作量、辨识度、成本及重现性要求较高，使其应用受到局限[2]。而多位点序列分型（multilocus sequence typing,MLST）技术依靠表征菌株不同管家基因位点的等位基因，可以区分不同菌株的序列类型（sequence type,ST）以及克隆复合体（clonal complex,CC），具有较高的区分性，已广泛用于致病菌的遗传多样性分析[3]。近些年该方法开始应用在非致病性食品菌株乳酸菌株的遗传多样性、种群结构及微进化研究中。……