杜 梅 梁泽毅 张剑搏 丁学智,2*

(1.中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所，甘肃省牦牛繁育重点实验室，兰州 730050；2.中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所，农业农村部兽用药物创制重点实验室，兰州 730050)

微生物组学和生物信息学等技术的快速发展，极大地促进了人们对动物肠道菌群结构、功能及其与宿主肠道免疫系统相互作用的认知。健康状态下肠道菌群与宿主共生，维持宿主正常生理功能，参与机体免疫系统调节，协同拮抗病原入侵等过程的发生。病原菌入侵或其他因素干扰造成肠道菌群稳态失衡，可能导致病原体感染、有害病原菌过度生长或炎性疾病发病率增加。目前，关于肠道菌群与宿主肠道免疫系统相互作用在其他哺乳动物上的研究较为深入[1-3]。然而，家畜品种、饲养环境、不同生长阶段营养需求模式及机体代谢差异等因素，极大地限制了反刍动物肠道菌群与宿主肠道免疫互作的系统研究。研究表明，新生反刍动物早期有益菌群的快速定植可促进回肠黏膜免疫系统功能的发育。随着年龄递增和饲料摄入量增加，肠道细菌总数与肠黏膜免疫基因的表达显著相关[4]，表现为肠道菌群在宿主营养物质消化、机体免疫和健康等方面起着非常重要的导向作用，尤其是与宿主腹泻[5]、乳房炎[6]、副结核病[7]和炎症性肠病[8]等疾病发生关系密切。因此，明晰反刍动物肠道菌群组成与功能及其与宿主肠道免疫反应的调控机理，对预防疾病的发生及维护动物健康尤为重要。……