AU结合因子1对肝细胞癌患者磷脂酰肌醇蛋白聚糖3水平的影响
2021-05-17关贵文鲁凤民陈香梅
张 婷,关贵文,张 婧,鲁凤民,陈香梅
北京大学基础医学院 病原生物学系,北京大学感染病研究中心,北京 100191
肝细胞癌(HCC)是全球常见的恶性肿瘤之一, 位列癌症相关死亡率的第四位[1-2]。尽管最近在HCC临床治疗方面取得了很多进展,但其治疗效果仍然欠佳,HCC术后5年生存率只有15%[3]。
磷脂酰肌醇蛋白聚糖3(GPC3)是一种硫酸肝素蛋白聚糖,位于细胞膜表面,在细胞增殖和分化中发挥重要作用[4-5]。研究[6-7]表明,GPC3在HCC中呈异常高表达,且具有很强的肿瘤特异性,被认为是HCC关键驱动分子。此外,GPC3表达水平与HCC的发生发展及预后密切相关,可作为HCC的诊断标志物和治疗靶点[4,8-9]。但GPC3在HCC中异常表达的机制尚未完全阐明。
腺苷酸-尿嘧啶富集元件(AU-rich elements,AREs)位于mRNA的3′UTR区,是最具特征的mRNA降解顺式作用因子。AREs可被ARE结合蛋白识别并结合,进而调控mRNA的稳定性及翻译[10-11]。AU结合因子1(AU-rich element RNA-binding factor 1,AUF1)也称异质核糖核蛋白D(hnRNPD),是第一个被鉴定出的ARE结合蛋白[12-13]。大量研究[14-15]表明,AUF1高亲和力结合富含AREs元件的mRNA并调控其稳定性。本研究中,首次发现GPC3 mRNA的3′UTR区含有AREs序列,AUF1可结合GPC3 mRNA,增强其稳定性,从而上调HCC中GPC3的表达。
1 材料与方法
1.1 TCGA、LCI数据库 TCGA-HCC基因表达数据下载自美国Bead研究所基因数据分析中心(http://gdac.broadinstitute.org)。采用FPKM (fragments per kilobase million) 法对TCGA转录组测序数据进行标准化,最终纳入371例不同病因的HCC组织及50例癌旁组织。
LCI-HCC基因表达数据下载自GSE14520(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo), 最终纳入214例有随访信息的乙型肝炎相关HCC患者。
1.2 临床标本 35例HCC及配对癌旁样本选取自2009年—2013年在河南省肿瘤医院接受常规根治性手术的HCC患者。所有患者均经病理诊断确诊,且均未在手术前接受任何化学疗法或放射疗法。……
