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大数据时代计算机辅助药物设计的教学思考*

2021-04-09周双艳张文英

广州化工 2021年17期
关键词:教学内容实验方法

周双艳,袁 帅,张文英

(重庆邮电大学生物信息学院,重庆 400065)

计算机辅助药物设计(Computer Aided Drug Design)是21世纪初兴起的一门新兴学科,融合了计算机科学、化学、生物学等学科知识,旨在通过联合计算机技术来推进新药研究与开发的进程,缩短药物研发周期,提高成功率。从出现伊始,计算机辅助药物设计也经历了相当漫长的发展过程。早期的计算机辅助药物设计可追溯到1964年Hansch[1]提出的定量构效关系模型,该模型通过数学函数式明确了药物结构与药物生物活性之间的构效关系。因此,定量构效关系模型的提出在一定程度上奠定了计算机辅助药物设计的基础,是计算机辅助药物设计发展史上的里程碑事件。进入21世纪初,计算化学、结构生物学、蛋白质组学、生物信息学等学科发展迅速,极大地推动了计算机辅助药物设计的发展,陆续出现了药效团模型、分子对接、全新药物设计、分子动力学模拟等方法和技术[2]。在这些方法和技术的助力之下,多项新药被研发成功并上市,如抗艾滋病药物沙奎那伟(Saquinavir)。自此,计算机辅助药物设计在药物研发中的地位被广泛认可,同时该技术也被视为药物分子设计过程中不可或缺的环节[3]。

近些年,互联网的飞速发展同时驱动着时代的重大变革,大数据、人工智能等成为了重要的时代标签。对计算机辅助药物设计的学科发展而言,大数据时代的到来既是机遇也是挑战。如何在大数据背景下以数据为核心,融合人工智能等知识体系内容来实施计算机辅助药物设计的教学是学科发展过程中迎接机遇,直面挑战的重中之重。……

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