SMC基因家族在肝癌中的表达及其预测肝癌预后的临床意义
2021-03-26霍励耘魏英城谭文亮商昌珍陈亚进
岭南现代临床外科 2021年1期
霍励耘,魏英城,谭文亮,商昌珍,陈亚进
原发性肝癌是全球第六大常见恶性肿瘤和第二大癌症相关死亡原因[1]。由于早期肝癌缺乏典型的临床症状,大多数肝癌患者在确诊时往往已进展至晚期,错失了手术治疗的最佳时机[2]。近年来,虽然以手术切除为主的综合治疗方法取得了一定的进展,但是肝癌患者的整体疗效和预后仍不理想[3]。因此,寻找新的早期诊断标志物以及治疗靶点对改善肝癌患者的预后具有重要的研究价值。
蛋白质复合体家族被称为染色体结构维持家族(structural maintenance of chromosome,SMC),家族成员主要包含SMC1、SMC2、SMC3、SMC4、SMC5和SMC6,通过形成异源二聚体参与维持染色体的稳定性[4-6]。SMC 基因家族已被报道在多种肿瘤的发生和发展中起重要作用。而在肝癌的研究中,目前仅有少量研究报道SMC 基因家族部分成员与肝癌的发生发展相关[7,8],SMC 基因家族在肝癌中的具体的作用机制仍需进一步的研究探索。在本研究中,我们通过提取公共数据库中的肝癌相关的转录组数据以及临床数据进行分析,对SMC 基因家族表达进行了全面的生物信息学分析,并探讨了SMC基因家族在肝癌患者中的诊断和预后价值,为后续进一步深入探索SMC 基因家族参与调控肝癌进展的具体分子机制提供了基础。
1 材料和方法
1.1 UALCAN 数据库
UALCAN 数据库是一个便捷的交互式数据库网站,用于对TCGA 基因表达数据进行深入分析[9]。在我们的研究中,我们使用UALCAN 数据库的“表达分析”模块和肝癌数据集获得了SMC 基因家族在肝癌和正常肝组织中的表达数据。……
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