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猪Viperin的C末端结构域促进PEDV RNA合成

2021-03-16董建国陈明睿何书海焦凤超张广强邓凯伟赵攀登

中国兽医杂志 2021年12期
关键词:拷贝数功能区质粒

董建国 , 陈明睿 , 饶 丹 , 何书海 , 焦凤超 , 张广强 , 邓凯伟 , 黄 立 , 赵攀登

(1. 信阳农林学院牧医工程学院 , 河南 信阳 464000 ; 2. 河南牧业经济学院动物医学院 , 河南 郑州 450046)

猪流行性腹泻(Porcine epidemic diarrhea,PED)于1971年在英国首次暴发,随后传播到世界许多国家,呈地方流行性[1-4]。2010年以后,我国许多养殖场发生严重腹泻,感染率高达100%,发病仔猪死亡率高达80%~100%,给我国养猪业造成严重的经济损失。研究显示,目前猪只的腹泻主要是由猪流行性腹泻病毒(PEDV)变异毒株引起[5-6]。

干扰素诱导内质网关联病毒抑制蛋白(Virus inhibitory protein,endoplasmic reticulum associated,interferon inducible,Viperin)是干扰素刺激基因(IFN-stimulated genes,ISGs)表达的蛋白之一[7]。该蛋白属于内质网相关蛋白,全长由361个氨基酸组成,包括3个关键的功能区。第1个功能区是N端,有助于细胞中Viperin蛋白的定位。第2个功能区位于Viperin中间区域,称为SAM 结构域[7]。第3个功能区是Viperin的 C-末端,该区域高度保守,具有抗病毒功能[8]。本试验通过扩增猪Viperin基因,构建Viperin各功能区质粒,转染Vero E6细胞研究Viperin各功能区对PEDV RNA合成的影响,为进一步研究宿主细胞中Viperin调控PEDV感染机制提供一定的理论依据。

1 材料与方法

1.1 材料与试剂 Vero E6细胞和PEDV GDgh 毒株由国家猪业工程技术中心猪病研究室(后文简称本实验室)保存[9];质粒pWPXL,购自Addgene公司;Lipofectamine®LTX,购自 Invitrogen 公司;化学发光检测试剂盒(RPN2135),购自GE Healthcare 公司;细胞裂解液(RIPA)(P0013)、PMSF(ST506)和 DAPI(C1005),均购自碧云天公司;PrimeSTARTMHS DNA Ploymerase PCR 扩增酶,购自宝生物工程(大连)有限公司;Wizard®Plus Midipreps DNA Purification System和蛋白酶K,均购自Promega公司;T4 DNA 连接酶、SupperMixTaqDNA聚合酶、dNTPs、DL2 000 Plus和DNA琼脂糖胶回收试剂盒,均购自北京全式金生物技术有限公司。

1.2 引物的设计与合成 参考GenBank 中已经发布的Viperin基因(登录号:NM_213817.1)序列信息,设计合成扩增猪Viperin基因各功能区的引物序列,进行PCR扩增及片段回收,最后将扩增片段连接到pWPXL载体上,载体上有GFP标签,位于多克隆位点后面,与插入基因融合表达,引物序列V△CF:AGCTTTGTTTAAACACCATGTGGACACTGGTAC,V△CR:CGCGCGACGCGTAAGGCCACTTTATAATCCCT,用于扩增Viperin△C结构域;V△NF:AGCTTTGTTTAAACACCATGGGGGGTGATAGGAGCC,V△NR:CGCGCGACGCGTAACCAGTCCAGCTTCAGGTC,用于扩增Viperin△N结构域;V△SAMF:AGCTTTGTTTAAACACCATGTGGACACTGGTAC,V△SAMR:CGCGCGACGCGTAACCAGTCCAGCTTCAGGTC,用于扩增Viperin△SAM结构域。以上引物均由苏州金维智科技有限公司合成。

1.3 重组表达质粒的构建 用以上引物以实验室保存的pWPXL-Viperin质粒为模板,扩增Viperin各功能域,并进行胶回收,用限制性内切酶PmeI和MluI将回收的各个功能域片段在37 ℃下酶切4 h,随后将酶切产物回收纯化,回收的片段与pWPXL质粒进行连接,连接产物转化TOP10感受态细胞,于37 ℃下摇菌45 min,接着3 000 r/min离心2 min,弃掉上清,将菌液涂于含氨苄霉素的 LB 平板上,随后将平板放置于37 ℃培养箱进行过夜培养。将鉴定阳性的菌落扩增,提取质粒,分别命名为 pWPXL-Viperin△N、pWPXL-Viperin△SAM、pWPXL-Viperin△C,并送苏州金维智科技有限公司进行测序。

1.4 重组蛋白质的免疫荧光和蛋白印迹鉴定 6孔板培养Vero细胞,待细胞密度达到70%~80%时,将重组质粒pWPXL、pWPXL-Viperin△N、pWPXL-Viperin△SAM、pWPXL-Viperin△C(重组质粒带有GFP标签)转染Vero E6细胞。每个质粒各做1个重复,1份用无水乙醇固定,荧光显微镜观察蛋白表达情况;另1份转染36 h后将Vero E6细胞收集,裂解后加入 Loading buffer,煮沸10 min,离心取上清进行 SDS-PAGE试验和Western Blot试验,PVDF膜于脱脂乳中室温封闭 2 h,随后加入GFP-Tag mAb室温孵育2 h,洗涤3次,加入羊抗小鼠IgG-HRP,室温轻摇0.5 h,洗涤3次,将显色液均匀滴加到PVDF膜上,用FluorChem E型凝胶成像仪显色。

1.5 Viperin对PEDV增殖的影响 Vero E6细胞转染pWPXL、pWPXL-Viperin质粒,转染后12 h接种PEDV(MOI=0.1),分别于感染后36 h和48 h收取细胞和上清,-20 ℃反复冻融3次,离心去除沉淀,收集上清,提取培养液中的核酸,荧光定量PCR检测PEDV拷贝数,确定Viperin基因过表达对PEDV增殖的影响,荧光定量PCR为TaqMan探针法,引物基于PEDVN基因进行设计,上游引物F:AACAACCTTCCAATTGGCATT;下游引物R:AACCCAGAAAACACCCTCAGT;探针:CTACTACCTYGGAACAGGACCTCACGG。

1.6 siRNA干扰Viperin基因对PEDV增殖的影响 针对猴Viperin基因(登录号:XM_005576618)序列设计3对siRNA分别干扰Vero E6细胞中的Viperin基因(表1),干扰后24 h收集细胞检测干扰效果;同时,对干扰的Vero E6细胞接种PEDV(MOI=0.1),分别于感染后36 h和48 h收取细胞和上清,-20 ℃反复冻融3次,提取培养液中的核酸,荧光定量PCR检测PEDV拷贝数,确定siRNA干扰Viperin基因对PEDV增殖的影响。

表1 干扰Viperin基因的siRNA序列信息Table 1 siRNA sequence for interfering Viperin gene

1.7 Viperin各功能区对PEDV增殖的影响 Vero E6细胞转染pWPXL、pWPXL-Viperin△N、pWPXL-Viperin△SAM、pWPXL-Viperin△C质粒,转染后12 h接种PEDV(MOI=0.1),分别于感染后36 h和48 h收取细胞和上清,-20 ℃反复冻融3次,提取培养液中的核酸,荧光定量PCR检测PEDV拷贝数,确定Viperin各功能域对PEDV增殖的影响。

2 结果

2.1 重组质粒的构建与鉴定 Viperin共包括3个功能区,C末端区域、N末端区域和Sam区域,Viperin△C是缺失C末端区域,Viperin△N是缺失N末端区域,Viperin△Sam是缺失Sam区域,各功能区如图1所示。用1.2中引物进行片段扩增,随后回收片段并用PmeI和MluI进行双酶切,连接后转化 TOP10感受态细胞,培养12~16 h,挑取阳性菌落扩增,提取质粒进行双酶切鉴定,结果表明Viperin基因成功克隆至 pWPXL 中(图2),将重组质粒命名为 pWPXL-Vip。随后进行测序,证实Viperin基因正确插入质粒中。

图1 Viperin各截短蛋白示意图Fig.1 Schematic diagram of each truncated Viperin protein

图2 Viperin各截短片段质粒酶切鉴定图Fig.2 Enzyme digestion identification map of each fragment plasmid of Viperin1:DNA Marker 10 000 bp; 2:pWPXL-Viperin△N; 3:pWPXL-Viperin△N双酶切; 4:pWPXL-Viperin△C; 5:pWPXL-Viperin△C双酶切; 6:pWPXL-Viperin△SAM; 7:pWPXL-Viperin△SAM双酶切1:DNA Marker 10 000 bp; 2:pWPXL-Viperin△N; 3:Double enzyme digestion of pWPXL-Viperin△N; 4:bpWPXL-Viperin△C; 5:Double enzyme digestion of pWPXL-Viperin△C; 6:pWPXL-Viperin△SAM; 7:Double enzyme digestion of pWPXL-Viperin△SAM

2.2 重组蛋白的免疫荧光鉴定 将构建成功的重组质粒分别转染Vero E6细胞,于转染后24 h 进行免疫荧光试验,如图3所示,各个转染细胞均有特异性荧光,完整蛋白Viperin、截短蛋白Viperin△C和Viperin△Sam在细胞质中表达,Viperin△N在细胞质和细胞核中均有表达。

图3 重组蛋白的荧光鉴定Fig.3 Fluorescence identification of recombinant protein

2.3 重组蛋白的Western Blot鉴定 运用Western Blot试验检测Vero E6细胞中各个截短蛋白的表达情况,结果显示完整蛋白Viperin、截短蛋白Viperin△N、Viperin△C和Viperin△Sam有特异性条带,表明在细胞中正确表达(图4)。

图4 Western Blot检测Viperin各截短蛋白在Vero细胞中的表达Fig.4 Western Blot analysis of each truncatedViperin protein in Vero cells

2.4 过表达Viperin对PEDV增殖的影响 为了确定Viperin对PEDV增殖的影响,pWPXL、pWPXL-Viperin△N、pWPXL-Viperin△SAM、pWPXL-Viperin△C质粒转染Vero E6细胞,于转染后24 h用PEDV (MOI=0.1)接种细胞,分别于接种后36 h和48 h收集上清和细胞,反复冻融3次,提取核酸,荧光定量RT-PCR检测PEDV在细胞中的病毒拷贝数,结果显示PEDV感染后36 h和48 h 拷贝数显著高于对照组(图5),说明Viperin能够促进PEDV RNA合成。

图5 过表达Viperin促进PEDV增殖Fig.5 Overexpression of Viperin promotes PEDV replication*:P<0.05,**:P<0.01,***:P<0.005;下同*:P<0.05,**:P<0.01,***:P<0.005. The same as below

2.5 干扰Viperin基因表达抑制PEDV增殖 设计3对siRNA,转染Vero E6细胞,分别于转染后24 h收集细胞,提取核酸,荧光定量RT-PCR检测细胞中Viperin的转录水平,结果显示设计的3对siRNA均能干扰Viperin的表达(图6A)。选取siViperin-2干扰Vero细胞中Viperin,随后接毒进行PEDV拷贝数检测,结果显示:与对照组相比,干扰细胞中Viperin能显著抑制PEDV RNA的合成(图6B)。

图6 干扰Viperin基因表达抑制PEDV增殖Fig.6 Interfering Viperin gene expression inhibits PEDV proliferationA:siRNA干扰Viperin转录效果检测; B:siRNA干扰Viperin对PEDV增殖的影响A:Detection of Viperin transcriptional effect of siRNA interference; B:Effects of siRNA interference with Viperin on PEDV proliferation

2.6 Viperin各功能区过表达对PEDV增殖的影响 将重组质粒pWPXL-Viperin△C、pWPXL-Viperin△N、pWPXL-Viperin△SAM分别转染Vero E6细胞,24 h后接种PEDV,接毒后24 h收取细胞和上清,提取核酸,荧光定量检测PEDV拷贝数,结果如图7所示,与对照相比,Viperin的C末端区域能够显著促进PEDV RNA的合成。

图7 Viperin各功能区对PEDV增殖的影响Fig.7 Effects of Viperin functional regoins on PEDV proliferation

3 讨论

干扰素(Interferon,IFN)是机体先天性免疫中重要的抗病毒因子,能够诱导不同的ISGs表达发挥不同的抗病毒作用。Viperin作为ISGs,一方面可以抑制病毒的复制,发挥抗病毒作用。研究显示:猪Viperin与猪瘟病毒E2和5A蛋白相互作用,抑制病毒增殖[10-11];猪Viperin还可以抑制猪繁殖与呼吸综合征病毒入侵和基因组的复制和转录[12];羊Viperin能够与山羊副流感病毒3型病毒N蛋白相互作用,抑制病毒增殖[13];鸡Viperin可能通过与新城疫病毒Matrix蛋白相互作用抑制病毒增殖[14]。Viperin抑制病毒复制机制是多样的,A型流感病毒感染过程中,Viperin破坏脂筏的形成进而抑制病毒复制[15]。马传染性贫血病毒感染过程中,Viperin可以阻止病毒Gag蛋白的出芽,进而抑制病毒增殖,同时Viperin还可以破坏宿主细胞内质网结构,阻断病毒囊膜的合成,同时Viperin还可以通过阻止马传染性贫血病毒受体蛋白ELR-1的表达,进而抑制马传染性贫血病毒侵入细胞[16]。

另一方面,Viperin又能促进病毒的增殖,对自身造成损害。研究表明,人Viperin通过与人巨细胞病毒的vMIA相互作用,抑制线粒体3功能蛋白功能,导致细胞骨架解聚,从而增强人巨细胞病毒的感染性[17-18]。本试验结果显示,Viperin的C末端能够显著促进PEDV RNA在Vero E6上的合成,猪Viperin是否有类似机制有待于进一步的研究。

本试验成功构建了表达猪Viperin的各个功能区真核质粒,并探讨了Viperin各个功能区对PEDV复制的影响,结果显示过表达Viperin C末端显著促进病毒RNA的合成。该试验为进一步探索抗病毒蛋白调控PEDV增殖的机制提供了科学依据。

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