猪Viperin的C末端结构域促进PEDV RNA合成
2021-03-16董建国陈明睿何书海焦凤超张广强邓凯伟赵攀登
董建国 , 陈明睿 , 饶 丹 , 何书海 , 焦凤超 , 张广强 , 邓凯伟 , 黄 立 , 赵攀登
(1. 信阳农林学院牧医工程学院 , 河南 信阳 464000 ; 2. 河南牧业经济学院动物医学院 , 河南 郑州 450046)
猪流行性腹泻(Porcine epidemic diarrhea,PED)于1971年在英国首次暴发,随后传播到世界许多国家,呈地方流行性[1-4]。2010年以后,我国许多养殖场发生严重腹泻,感染率高达100%,发病仔猪死亡率高达80%~100%,给我国养猪业造成严重的经济损失。研究显示,目前猪只的腹泻主要是由猪流行性腹泻病毒(PEDV)变异毒株引起[5-6]。
干扰素诱导内质网关联病毒抑制蛋白(Virus inhibitory protein,endoplasmic reticulum associated,interferon inducible,Viperin)是干扰素刺激基因(IFN-stimulated genes,ISGs)表达的蛋白之一[7]。该蛋白属于内质网相关蛋白,全长由361个氨基酸组成,包括3个关键的功能区。第1个功能区是N端,有助于细胞中Viperin蛋白的定位。第2个功能区位于Viperin中间区域,称为SAM 结构域[7]。第3个功能区是Viperin的 C-末端,该区域高度保守,具有抗病毒功能[8]。本试验通过扩增猪Viperin基因,构建Viperin各功能区质粒,转染Vero E6细胞研究Viperin各功能区对PEDV RNA合成的影响,为进一步研究宿主细胞中Viperin调控PEDV感染机制提供一定的理论依据。
1 材料与方法
1.1 材料与试剂 Vero E6细胞和PEDV GDgh 毒株由国家猪业工程技术中心猪病研究室(后文简称本实验室)保存[9];质粒pWPXL,购自Addgene公司;Lipofectamine®LTX,购自 Invitrogen 公司;化学发光检测试剂盒(RPN2135),购自GE Healthcare 公司;细胞裂解液(RIPA)(P0013)、PMSF(ST506)和 DAPI(C1005),均购自碧云天公司;PrimeSTARTMHS DNA Ploymerase PCR 扩增酶,购自宝生物工程(大连)有限公司;Wizard®Plus Midipreps DNA Purification System和蛋白酶K,均购自Promega公司;T4 DNA 连接酶、SupperMixTaqDNA聚合酶、dNTPs、DL2 000 Plus和DNA琼脂糖胶回收试剂盒,均购自北京全式金生物技术有限公司。
1.2 引物的设计与合成 参考GenBank 中已经发布的Viperin基因(登录号:NM_213817.1)序列……
