2009—2018年辽宁省急性弛缓性麻痹监测中肠道病毒A组71型VP1区基因特征分析
2021-02-25任丽萍邵玉平陈涛王艳方兴韩悦姚文清
任丽萍,邵玉平,陈涛,王艳,方兴,韩悦,姚文清
辽宁省疾病预防控制中心,辽宁 沈阳 110005
急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis,AFP)病例定义为所有15岁以下出现AFP症状的病例及任何年龄临床诊断为脊髓灰质炎的病例均作为AFP病例。引起儿童AFP的病原除脊髓灰质炎病毒外,还包括肠道病毒A组71型(EV-A71)、柯萨奇病毒、埃可病毒等非脊髓灰质炎肠道病毒(non-polio enterovirus,NPEV)[1]。EV-A71 属小核糖核酸病毒科(Picornaviridae)肠道病毒属(Enterovirus)A 组肠道病毒[2],该病毒除引起AFP外,还可引起手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)、疱疹性咽峡炎、无菌性脑膜炎等[2]。近年来EV-A71多与手足口病的暴发相关,是引起手足口重症病例的病毒类型[3]。至2015年,EV-A71被分为7个基因型(A~G)和14个基因亚型[3-5],其中,中国内地的C4基因亚型分为C4a及C4b 2个进化分支[4-5]。
本文对2009—2018年辽宁省AFP病例中EVA71分离株进行VP1基因特征分析,旨在为辽宁省AFP监测提供病原学依据。
1 材料与方法
1.1 标本 病例来自2009—2018年辽宁省AFP监测系统,14 d内的麻痹病例双份粪便标本由县区疾控中心采集,7 d内送至辽宁省疾控中心脊灰实验室,-20℃保存。
1.2 细胞及毒株 横纹肌肉瘤RD细胞及转脊灰病毒受体的小鼠肺L20B细胞均由中国疾病预防控制中心病毒病所脊灰实验室提供;EV-A71原型株(U22521_BrCr/1970/A)及EV-A71 C4亚型的C4a分支(FJ469153_BJ/CHN/2008/C4a)均从GenBank下载。
1.3 主要试剂及仪器 QIAGEN RNeasy Mini Kit试剂盒、One Step RT-PCR Kit试剂盒及QIAquick Gel Extraction Kit胶纯化试剂盒均购自德国QIAGEN公司;Big Dye Terminator V3.0 Cycle Sequencing kit试剂盒及ABI3100测序仪均购自美国ABI公司。
1.4 病毒分离 根据WHO《脊髓灰质炎实验室手册》[1]及补充资料,用L20B细胞及RD细胞对粪便标本进行病毒分离,RD细胞呈阳性而L20B细胞呈阴性的为NPEV。
1.5 RT-PCR扩增 用QIAGEN RNeasy Mini Kit试剂盒提取病毒RNA。引物为EV-A71特异性引物2386S 及 011[6],上游引物 2386S:5′-CTATGAAGTTGTGTAAGGAT-3′;……
