实时荧光定量PCR是检测结直肠癌BRAF V600E突变的理想方法
2021-01-22王丛阳郭文文王家俊
王丛阳,郭文文,王家俊,熊 林,金 宁,王 焱
结直肠癌是消化道常见的恶性肿瘤之一,约有15%发生BRAF基因突变,而BRAF基因突变约90%为BRAF V600E突变。目前对BRAF V600E突变的检测手段有两种:免疫组化和分子检测,分子检测目前应用较多的是荧光定量PCR技术。本实验应用免疫组化和实时荧光定量PCR(real-time fluorescence quantitative PCR, qRT-PCR)技术对结直肠癌标本BRAF V600E突变状况进行检测,并对这两种检测方法结果进行分析,以期评价这两种方法在结直肠癌中的应用价值。
1 材料与方法
1.1 临床资料收集2018年1月~2019年12月南京医科大学第二附属医院病理科存档的结直肠癌标本113例,其中男性65例,女性48例,平均年龄69岁。113例结直肠癌标本均同时行免疫组化和qRT-PCR检测BRAF V600E的突变状况。
1.2 试剂(1)免疫组化试剂:BRAF V600E鼠单克隆抗体(克隆号VE1)、Opti View DAB免疫组化检测试剂盒、苏木精染液、返蓝染液均购自美国Roche公司。(2)qRT-PCR试剂:核酸提取试剂盒、人类BRAF V600E突变检测试剂盒均购自厦门艾德生物公司。
1.3 方法
1.3.1免疫组化 手术标本均经10%中性福尔马林固定12~48 h,常规全自动脱水机脱水,石蜡包埋,经全自动切片机3~4 μm厚切片,60 ℃烤片1 h,Ventana全自动免疫组化仪上机检测。BRAF V600E检测全自动免疫组化的设置流程:脱蜡76 ℃ 16 min;修复100 ℃ 64 min;一抗孵育37 ℃ 24 min;苏木精37 ℃ 8 min;返蓝37 ℃ 4 min。全自动染色结束后,将染色后的玻片放在加入洗涤剂的水中清洗,以去除玻片上的油膜,常规脱水、透明、封片,显微镜下观察。结果判读:BRAF V600E蛋白阳性细胞胞质呈棕黄色。
1.3.2qRT-PCR (1)DNA提取:经显微镜下观察,挑选肿瘤细胞占比>50%的组织蜡块,刮取6~8 μm厚组织4~5片至离心管中,二甲苯脱蜡后按照核酸提取试剂盒说明书提取基因组DNA,提取的DNA经紫外分光光度计测定其浓度和纯度,以确保OD260/OD280在1.8~2.0之间。检……
