RNA m6A甲基化参与肾脏纤维化进展的实验研究
2021-01-21陈静张函顾玉露丁小强章晓燕
陈静 张函 顾玉露 丁小强 章晓燕
200032 上海,复旦大学附属中山医院肾内科
慢性肾脏病(chronic kidney disease,CKD)是一种严重危害人类健康的慢性疾病。RNA甲基化主要发生在N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)位点[1]。m6A修饰在基因表达调控、mRNA剪接、RNA稳定性等方面扮演重要角色[2]。m6A修饰主要由甲基化酶(writers)、去甲基化酶(erasers)和识别蛋白(readers)所调控,参与RNA剪接、出入核、蛋白质翻译及降解等多种生物学过程[3-5]。甲基化RNA免疫共沉淀结合高通量测序(Methylated RNA Immunoprecipitation with next generation sequencing,MeRIP-seq)[5],使用N6-甲基腺嘌呤抗体富集高甲基化的RNA片段,并通过结合高通量测序,能够高效精确的在全转录组范围内检测发生甲基化的RNA区域。通过使用这一技术,我们可以比较不同细胞、组织、样本间的RNA甲基化修饰模式的差异,发现疾病发生、发展过程中的关键生物学改变[6-7]。
近年研究表明,m6A在肿瘤发生、发展中发挥重要作用[1]。但在肾脏纤维化发生过程中m6A变化如何、扮演什么角色?目前还不明确。本研究基于MeRIP-seq数据库解析肾脏纤维化发生过程中RNA m6A的变化,筛选出差异基因和关键通路,初步确定参与调控RNA m6A的关键甲基酶,为肾脏纤维化的RNA甲基化机制研究提供重要理论参考。
材料与方法
一、实验动物与试剂
1.动物 健康的6~8周龄雄性小鼠(种系C57BL/6),重量19~24 g,购自上海杰思捷生物科技有限公司,自由进食饮水。
2.试剂 PrimeScript RT试剂盒(日本Takara公司)、RNAiso Plus(Trizol)(美国Thermo公司)、SYBR Green PCR试剂盒(日本Takara公司)
二、方法
1.动物模型与实验分组 C57BL/6小鼠适应环境7 d。采用随机数字表法分成2组:假手术组(Sham组)(n=6)、肾脏纤维化组(UUO组)(n=6)。UUO组经小鼠背部右侧切口将小鼠右侧输尿管游离、结扎并剪断,Sham组仅游离右侧输尿管不结扎。……
