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量子化学计算 对自由基清除肽的构效关系

2018-09-13董梦依王倩芸刘科梅

食品工业科技 2018年16期

董梦依,王倩芸,刘科梅,陆 豫,余 勃,*

(1.南昌大学资源环境与化工学院,江西南昌 330031; 2.南昌大学食品科技学院,江西南昌 330031; 3.南昌大学中德联合研究院,江西南昌 330047)

本研究选取12种具有代表性的短肽链RSP作为研究对象,采用半经验AM1和密度泛函理论(DFT)等量子化学计算方法对这些多肽清除自由基活性进行理论计算研究,从而对RSP中的活性基团进行定性判断。同时通过试验测定这些多肽对DPPH自由基、超氧阴离子自由基、羟自由基的清除活性,探讨RSP自由基清除能力与量化参数之间的关系。

1 材料与方法

1.1 材料与设备

1,1-二苯基-2-三硝基苯肼(1,1-Diphenyl-2-picrylhydrazyl radical,DPPH)试剂盒 美国Sigma;天冬氨酸-谷氨酸-谷氨酸(Asp-Glu-Glu,DEE)、甘氨酸-丙氨酸-组氨酸(Gly-Ala-His,GAH)、甘氨酸-甘氨酸-谷氨酸(Gly-Gly-Glu,GGE)、亮氨酸-丙氨酸-精氨酸(Lue-Ala-Arg,LAR)、色氨酸-脯氨酸-亮氨酸(Trp-Pro-Lue,WPL)、酪氨酸-亮氨酸-谷氨酸(Tyr-Lue-Glu,YLE)、甘氨酸-丙氨酸-色氨酸-丙氨酸(Gly-Ala-Trp-Ala,GAWA)、丝氨酸-丝氨酸-甘氨酸-谷氨酸(Ser-Ser-Gly-Glu,SSGE)、组氨酸-缬氨酸-苏氨酸-谷氨酸-谷氨酸(His-Val-Thr-Glu-Glu,HVTEE)、亮氨酸-亮氨酸-脯氨酸-组氨酸-组氨酸(Lue-Lue-Pro-His-His,LLPHH)、甘氨酸-丙氨酸-亮氨酸-丙氨酸-丙氨酸-组氨酸(Gly-Ala-Lue-Ala-Ala-His,GALAAH)、酪氨酸-苯丙氨酸-酪氨酸-脯氨酸-谷氨酸-亮氨酸(Tyr-Phe-Tyr-Pro-Glu-Lue,YFYPEL)片段(纯度>95%) 上海楚肽生物技术有限公司进行固相合成而得;Tris-HCl 缓冲液(pH=8.2)、邻苯三酚、无水乙醇 天津市大茂化学试剂厂。

TU-1810PC紫外可见光分光光度计 北京普析公司;Finnpipette微量移液器 美国热电公司;T型恒温水浴锅 德国LAUDA公司;ER-180A型电子分析天平 日本AND公司。

1.2 自由基清除能力的测定

式中:ΔA0为邻苯三酚的自氧化速率(吸光度每分钟的增值);ΔA为加入样品溶液后邻苯三酚的自氧化速率(吸光度每分钟的增值)。

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