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泛素特异肽酶3作为膀胱癌新型预后标记物的研究

2018-08-13尤洪科尹永华文博

微创泌尿外科杂志 2018年4期
关键词:数据库

尤洪科 尹永华 文博

1广州医科大学附属深圳沙井医院泌尿外科 518104 广东深圳

膀胱癌(bladder cancer)在我国发病率远高于前列腺癌和肾癌,位于泌尿生殖系统肿瘤第一位[1]。针对膀胱癌的分子预后研究可以进一步制定肿瘤的个体化治疗和随访监测方案。然而,由于既往肿瘤分子预后研究需要大样本量的肿瘤标本进行检测,工作量大、时间长而且研究成本非常高,因此,目前临床上能用于判断膀胱癌预后的生物标记物比较少。生物信息学是近年来非常热门的研究工具,结合庞大且可信度高的基因检测和肿瘤信息数据库,为探索膀胱癌预后分子标记提供了极大的方便[2, 3]。

泛素特异肽酶3(ubiquitin specific peptidase 3, USP3)最早于1999年被发现,基因定位于人类染色体15q22.3,分子量为59 kd,它也是目前已知的第二个能够裂解泛素-脯氨酸结合的泛素特异蛋白酶,维持基因组的稳定性[4, 5]。研究表明,USP3可以通过去泛素化调节目的蛋白的表达水平,与肿瘤的发生发展密切相关[6, 7]。然而,到目前为止关于USP3在膀胱癌中的表达和作用尚未见相关研究报道。本课题首先运用Oncomine数据库比较USP3基因在正常膀胱组织和膀胱癌中的差异性表达,并利用免疫印迹试验、定量PCR和免疫组化进行验证,结合美国癌症基因组图谱(TCGA)数据,分析USP3预测膀胱癌预后的作用以及作用机制,为后续研究提供基础。

1 材料与方法

1.1 实验材料

人膀胱癌细胞系T24和J82以及人正常尿路上皮细胞SV-HUC-1购自中国科学院上海典型培养物保藏中心。胎牛血清、Opti-DMEM高糖无血清培养基购自美国Gibco公司;……

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