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蛋白组学差异揭示黑曲霉(Aspergillus niger)高产柠檬酸的分子机制

2018-08-10王风清魏东芝

中国酿造 2018年7期
关键词:高产差异

谢 慧,王风清,魏东芝*

(1.华东理工大学 生物反应器国家重点实验室,上海 200237;2.河南农业大学 生命科学学院,河南 郑州 450002)

我国是柠檬酸生产大国,占全球市场份额的70%以上,在产量和产品质量上均具有很强的竞争力。中国柠檬酸工业的强大竞争力主要得益于生产菌种具有利用廉价淀粉类物质高产柠檬酸的强大能力[1-2]。菌株(Aspergillus niger)YX-1217是一株典型的柠檬酸高产菌株,能利用玉米粉水解液,在38~39℃发酵55h产生180.0~200.0g/L柠檬酸。然而A.nigerYX-1217在遗传上不稳定,易于自然衰退,为了保持菌株高柠檬酸产量的特性,必须定期进行菌种活化,否则会衰退为低产柠檬酸菌株(命名为A.nigerYX-1217G),产酸量只有高产菌株的70%,为企业带来巨大经济损失[3]。

常见的蛋白质组学研究方法包括二维聚丙烯酰胺凝胶电泳(two-dimensionalpolyacrylamide gelelectrophoresis,2-DE)、质谱技术(mass spectrometer,MS)、肽序列标签、蛋白质微阵列、核磁共振(nuclear magnetic resonance,NMR)技术以及其他研究蛋白质相互作用的方法如酵母双杂交系统等[4-8]。近年来,由美国应用生物系统公司(appliedbiosystems,ABI)研发的同位素标记相对和绝对定量(isobaric tagsforrelativeandabsolutequantification,iTRAQ)技术为解决低丰度蛋白质的定性及定量研究提供了有效的技术支持[9-10]。KIM Y等[11]总结了应用于曲霉蛋白质组学研究中的各种方法和技术,结果共鉴定了28个细胞表面蛋白,102个与分泌相关的蛋白以及139个胞内蛋白,同时也构建了代谢途径中关键基因的蛋白质组图谱。蛋白质组学技术不仅可以用于真菌致病机理的研究,也可用于丝状真菌的代谢网络调节研究。LU X等[12]分别以麦芽糖和木糖为碳源,对在诱导和非诱导条件下A.niger的蛋白质组进行比较,研究表明,在诱导和非诱导条件下胞浆蛋白质组并没有明显的差异,主要差异体现在胞外分泌蛋白,特别是植物细胞壁降解蛋白。……

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