不同DNA提取方法对肺癌血浆循环DNA抽提效果比较
2018-05-10李旺胜唐一通张楚微王书菲徐洲杜陈金钊
李旺胜 唐一通 张楚微 王书菲 徐洲 杜陈 金钊
摘要:目的:研究不同DNA抽提方法对肺癌血浆循环DNA的提取效果。方法:选取68例肺癌患者为研究对象,比较GenMagBio磁珠法、SanPrep柱式PCR产物纯化试剂盒方法、苯酚-氯仿法对肺癌血浆循环DNA的提取效果。结果:几种方法中,磁珠法具有最高的提取效率和最低的CV值。结论:磁珠法对肺癌血浆循环DNA具有最好的抽提效果,适合于对小片段DNA的提取。
关键词:肺癌;循环DNA;抽提方法
中图分类号:G642.423 文献标志码:A 文章编号:1674-9324(2018)11-0274-02
循环DNA是存在于人和動物体液中的胞外DNA分子。研究表明,健康人群循环DNA含量极低(约5 μg/L左右)。当机体在炎症、自身免疫病和肿瘤等情况下,其在体液中的含量会大大增加,机制至今仍不明确。因为循环DNA与包括肿瘤在内的一些疾病的产生与发展密切相关,所以其对于肿瘤等疾病的早期诊断和疗效评价具有重要的临床意义。本文分别采用不同的DNA提取方法对肺癌患者的血浆循环DNA进行抽提,其结果报告如下。
一、资料与方法
1.一般资料:以2016年9月—2017年4月的68例肺癌患者为研究对象,其中男43例,女25例,平均年龄(58.2±4.6)岁。
2.方法:所有肺癌患者取静脉血5ml置于EDTA抗凝管中,以3000r/min,离心10min吸取上清血浆于冻存管中,-80℃保存备用。分别参照试剂盒及文献报道方法用血清游离DNA提取试剂盒(北京金麦格生物技术有限公司)、SanPrep柱式PCR产物纯化试剂盒(Sangon Biotech)、苯酚-氯仿法对肺癌血浆循环DNA进行提取。选取K-ras基因为目标基因,并设计扩增探针(Forward primer:5'-ATTAAAAGGTACTGGTGGAG-3';Reverse primer:5'-CTATTGTTGGATCATATTCG-3'),对三种抽提方法所得循环DNA样本K-ras基因外显子2基因序列进行PCR扩增。……
