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建立荧光定量PCR方法鉴定1例入境人员携带伊科普玛病毒基因

2017-11-20夏冬宋娟罗小暖宋芹芹王欣玲武桂珍韩俊

中华实验和临床病毒学杂志 2017年5期
关键词:检测

夏冬 宋娟 罗小暖 宋芹芹 王欣玲 武桂珍 韩俊

102206 北京,中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所病毒资源中心

·技术方法·

建立荧光定量PCR方法鉴定1例入境人员携带伊科普玛病毒基因

夏冬 宋娟 罗小暖 宋芹芹 王欣玲 武桂珍 韩俊

102206 北京,中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所病毒资源中心

目的建立用于检测伊科普玛病毒(Ekpoma virus, EKV)基因的实时荧光定量PCR(qPCR)的检测方法。方法根据GenBank中EKV-1和EKV-2基因的保守序列,设计引物和探针,建立检测EKV-1和EKV-2基因的qPCR方法;使用建立的EKV-1和EKV-2病毒qPCR的检测方法,对1名入境人员携带伊科普玛病毒血清和全血样本的检测。结果建立了检测EKV-1和EKV-2病毒Taqman探针的荧光定量qPCR检测方法,成功检测出1名安哥拉入境人员血清和全血样本中携带EKV-2基因。结论建立的qPCR检测方法可用于血液标本中EKV-1和EKV-2的检测。

伊科普玛病毒属于弹状病毒科蒂布鲁病毒属(Tibrovirus)。弹状病毒科是病毒颗粒形态呈棒状或子弹状的一类病毒,宿主范围广泛,其中已知与人类相关的有狂犬病毒属、水疱病毒属、蒂布鲁病毒属。蒂布鲁病毒属主要包括泰布罗加根病毒(Tibrogargan Virus)、下刚果病毒(Bas-Congo virus)、伊科普玛病毒等[1-3]。

伊科普玛病毒首次报道于2015年3月。当时,美国研究小组在尼日利亚东南部地区进行不明原因急性发热病例调查。通过二代测序技术,在作为对照组的健康人群血液中偶然发现两个不同于已知病原的新基因序列。对这两个全长约12 kb的基因组序列进行测定后,分别命名为EVK-1和EVK-2(2名健康人来自尼日利亚伊科普玛村)。……

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