番茄NF-Y转录因子生物信息学分析及其与RIN共同调控果实成熟研究
2017-11-13许蕙金兰朱本忠罗云波
食品科学 2017年22期
关键词:分析
李 珊,许蕙金兰,朱本忠,罗云波*
(中国农业大学食品科学与营养工程学院,北京 100083)
番茄NF-Y转录因子生物信息学分析及其与RIN共同调控果实成熟研究
李 珊,许蕙金兰,朱本忠,罗云波*
(中国农业大学食品科学与营养工程学院,北京 100083)
运用生物信息学分析方法,对番茄NF-Y家族59 个成员的结构域和进化关系进行分析,并比较番茄NF-Y基因在番茄野生型AC及rin突变体果实成熟过程中的表达量变化,结合转录因子RIN对NF-Y基因DNA的结合能力,分析其可能的互作关系。研究结果为阐述番茄NF-Y转录因子与RIN共同调控果实成熟的功能提供理论依据。
番茄果实;NF-Y;RIN;生物信息学分析
果实成熟是一个复杂的动态过程,涉及果实质构、色泽和风味物质等变化[1]。在这个过程中,许多因子通过调控成熟相关基因的表达,从而发挥了对果实成熟过程的重要调控作用。其中,相关转录因子就是其中很重要的一类调控因子[2]。目前,已经有许多家族的转录因子被研究发现参与了果实的成熟调控过程,如M ADS-box、M YB、AP2/ERF以及SBP/SPL等[2]。在众多转录因子家族中,MADS-box转录因子RIN是果实成熟的关键调控因子之一,因为在RIN转录因子功能缺失的番茄rin突变体中,许多成熟相关的途径受到影响,比如果实乙烯合成受到抑制、果实不能正常软化,以及色泽的形成受到影响,果实的成熟过程无法正常启动,最终导致果实严重不成熟的表型[3-4]。近些年的研究发现,转录因子RIN通过调控许多成熟相关的基因影响果实的成熟进程,比如成熟相关的转录因子基因,包括NOR、HB1、CNR和TDR4等[3];……
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