膀胱尿路上皮癌与正常尿路上皮组织LncRNA表达谱差异性的研究
2016-08-23罗华荣刘昭辉吴登龙王天如
罗华荣,刘昭辉,吴登龙,洪 哲,赵 鑫,王天如
(上海市同济医院,上海 200065)
膀胱尿路上皮癌与正常尿路上皮组织LncRNA表达谱差异性的研究
罗华荣,刘昭辉,吴登龙,洪哲,赵鑫,王天如
(上海市同济医院,上海200065)
目的利用基因芯片技术,检测人膀胱尿路上皮癌与正常膀胱组织之间LncRNA表达谱的差异,对差异表达的LncRNA进行分类汇总,分析其生物学信息。方法取人膀胱尿路上皮癌组织与配对的癌旁正常组织3对。分别提取尿路上皮癌组织及正常癌旁组织的总RNA并纯化RNA,与人LncRNA芯片杂交。使用Agilent Genespring GX (Agilent)软件分析尿路上皮癌组织及正常癌旁组织的LncRNA表达情况。结果人膀胱尿路上皮癌组织与配对的癌旁正常组织的LncRNA表达谱差异明显。以P<0.05, 上调或下调信号差异大于2倍变化为标准,与正常膀胱组织比较,共筛选出差异表达基因1 122个,其中上调基因734个,下调基因388个。结论膀胱尿路上皮癌的发生发展是一个涉及多基因调控、多条染色体参与的复杂过程。所获得的膀胱癌差异表达LncRNA,尤其差异表达明显的上调基因AK124776、lincRNA-RAB12-1、KRT8P25、RP11-474J18.4、AC000110.1、KRT8P13、KRT8P10、BC072678等、下调基因nc-HOXB9-206、RP11-160A10.2、nc-HOXA11-86、nc-HOXD10-7、nc-HOXB9-205、CES4、nc-HOXD12-3等,考虑上述上调、下调基因对于膀胱癌发生的分子机制及膀胱癌的临床早期诊疗具有重要意义。
LncRNA;基因芯片;膀胱;尿路上皮癌;表达谱
DOI:10.3969/j.issn.1009-8291.2016.07.015
膀胱恶性肿瘤是泌尿系统最常见的肿瘤之一,全球范围内占恶性肿瘤发病率的第9位[1],其病理类型包括尿路上皮细胞癌(urothelial carcinoma,UCC),腺细胞癌,鳞状细胞癌等,其中UCC是最常见的病理类型。膀胱肿瘤的治愈与否完全取决于是否能够早期预防、早期诊断、早期治疗,所以寻找合适的敏感性高、特异性强的肿瘤标志物成为了我们研究的重点。
近年来随着分子生物学的发展,人们对UCC发生发展过程中的细胞和分子水平的变化有了更深刻全面的认识,并进行了大量研究试图探讨UCC发生的分子和细胞机制,寻找膀胱肿瘤的特异性标志物。UCC发生发展的许多环节尚不能用单一的分子或基因变化来解释,UCC的发生和发展涉及复杂的,多步骤的及多种基因的参与过程。……
