油橄榄查尔酮合酶与查尔酮异构酶基因全长的克隆及序列分析
2015-12-13陈文拴黄乾明陈华萍杨泽身王安逸苏光灿
陈文拴,黄乾明,*,陈华萍,杨泽身,王安逸,苏光灿
(1.四川农业大学理学院,四川 雅安 625014;2.凉山州中泽新技术开发有限责任公司,四川 西昌 615000)
油橄榄查尔酮合酶与查尔酮异构酶基因全长的克隆及序列分析
陈文拴1,黄乾明1,*,陈华萍1,杨泽身2,王安逸2,苏光灿2
(1.四川农业大学理学院,四川 雅安 625014;2.凉山州中泽新技术开发有限责任公司,四川 西昌 615000)
查尔酮合酶(chalcone synthase,Chs)与查尔酮异构酶(chalcone isomerase,Chi)是植物类黄酮合成代谢途径中的两个关键酶。采用同源克隆、反转 录聚合酶链式反 应(reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)、融合引物嵌套PCR(fusion primer and nested integrated PCR,FPNI-PCR)与3’-cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA end,RACE)相结合,分别 克隆出油橄榄chs与chi基因全长。序列分析表明,油橄榄chs基因全长DNA(GenBank登录号:KF935223.1)和cDNA(GenBank登录号:KF935224.1)序列分别为2 085 bp和1 173 bp,该基因的开放阅读框(open read ing frame,ORF)编码390 个氨基酸,其氨基酸序列与葡萄和番茄全长Chs氨基酸序列的相似度在90%左右。生物信息学分析表明,该基因编码的蛋白属于Chs蛋白家族。油橄榄chi基因全长DNA(GenBank登录号:KF886190)和cDNA(GenBank登录号:KF886191)序列分别为1 373 bp和750 bp,其ORF编码249 个氨基酸,该氨基酸序列与已报道的其他植物Chi氨基酸序列的相似度最高在65%左右,序列中包含一段由198 个氨基酸残基组成的具有分子内裂解酶活性的功能域,符合 Chi蛋白家族特征。
油橄榄;查尔酮合酶;查尔酮异构酶;基因克隆;序列分析
油橄榄(Olea europaea)属于木犀科,木樨榄属,常绿阔叶乔木,其果实主要用来压榨生产有“液体黄金”之称的橄榄油[1-2]。在油橄榄中除脂肪酸外关注较多的是具有抗氧化活性的物质,其中以黄酮类化合物最具代表性[3-4]。研究发现,黄酮……
