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1株中度嗜盐菌质粒基因组文库的构建及2个膜蛋白基因的克隆和序列分析

2012-10-25朱文华董冠群滕长财孙业盈

微生物学杂志 2012年6期

朱文华,董冠群,滕长财,侯 娟,吕 彦,孙业盈*

(1.滨州医学院 药学院,山东 烟台 264003;2.烟台大学 生命科学学院,山东 烟台 264005)

中度嗜盐菌(modrately halophilic bacteria)近年来正受到越来越多的重视,与此相关的中度嗜盐菌的分离,鉴定,基因组学研究以及耐盐机理的研究也日益广泛和深入。中度嗜盐菌是生活在极端高盐环境中的微生物,具有较强的耐盐能力,能在含有0% ~32%NaCl的环境中生长,最适盐度为3% ~15%[1-2]。中度嗜盐菌广泛分布在不同的高盐环境中如盐湖、海洋、盐碱地和盐渍发酵食品等[3-6]。嗜盐细菌主要通过2种机制来适应高渗透压的外界环境:一种是通过在细胞内积累高浓度的盐离子如KCl和NaCl等,来使细胞内的渗透压升高,从而平衡外界环境的高渗透压,如Halobacteriaceae和Salinibacter类嗜盐菌都是通过此机制来实现耐盐的;另一种是通过在细胞内合成或者积累高浓度的相容性溶质,来升高细胞内的渗透压,抗衡细胞外的高渗透压对细胞的影响[7]。虽然,目前研究人员已经发现了部分嗜盐菌的耐盐策略,但是对其如何通过怎样的基因表达调控网络来实现这一过程还不清楚。因此对嗜盐菌进行深入的基因组学,转录组学和蛋白组学的研究,发掘克隆相关的基因,对它们进行功能研究就显得尤其重要。先前的研究中从蜢子虾酱中分离纯化鉴定了1株中度嗜盐菌,通过测定其16S rDNA序列,并通过系统发育分析将该菌初步鉴定为枝芽胞杆菌属(Virgibacillus)中的盐脱氮枝芽胞杆菌(Virgibacillus halodenitrificans)[8]。本研究进一步通过构建该中度嗜盐菌的质粒基因组文库,经测序,比对分析克隆了2个膜蛋白基因,并对它们进行了生物信息学的相关分析。……

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