平菇基因组DNA提取方法的研究
2011-11-02许文涛苏春元罗云波王一南谷新晰戴蕴青田洪涛
闫 燕,许文涛,苏春元,罗云波,王一南,谷新晰,戴蕴青,田洪涛,*
(1.河北农业大学食品科技学院,河北保定071001; 2.中国农业大学食品科学与营养工程学院,北京100083; 3.农业部转基因生物食用安全监督检验测试中心(北京),北京100083)
平菇基因组DNA提取方法的研究
闫 燕1,2,3,许文涛2,3,苏春元2,罗云波2,王一南3,谷新晰1,戴蕴青2,3,田洪涛1,*
(1.河北农业大学食品科技学院,河北保定071001; 2.中国农业大学食品科学与营养工程学院,北京100083; 3.农业部转基因生物食用安全监督检验测试中心(北京),北京100083)
以实验室自行培育的平菇为实验材料,分别使用CTAB法、SDS-CTAB法以及高盐酶解法提取平菇基因组DNA,并通过紫外分光光度计、限制性酶切及PCR检测来衡量基因组质量。结果表明,使用CTAB法很难得到高质量的基因组DNA,OD260/280仅为1.5左右,而且伴有较多的杂质,电泳条带拖尾严重;使用EcoRI限制性酶对其进行酶切分析,效率较低,同时PCR检测不能得到有效扩增;而使用优化后的SDS-CTAB法及高盐酶解法提取平菇DNA,能够获得质量高、纯度好的基因组DNA,OD260/280基本保持在1.8~2.0之间,电泳条带较为清晰均一,使用EcoRI限制性酶对其进行酶切分析,酶切效果较好,并且DNA质量能够满足PCR检测的模板要求。说明SDS-CTAB法以及高盐酶解法提取的平菇DNA能够满足分子水平操作的要求,两者相比,前者成本较低,后者产率较高。
平菇,基因组DNA,提取方法
1 材料与方法
1.1 材料与仪器
平菇 实验室自行培育、分离,研究部分为菌皮、菌肉、菌褶以及菌柄四部分,分别标记为1、2、3、4号;DL2000 DNA marker(300ng/5μL) 大连宝生物工程有限公司……
