孔晶晶，田珺劼，任玉鹏*，陈弟诗，包 昕

（1.西南民族大学畜牧兽医学院，四川 成都 610041；2.四川省动物疫病预防控制中心，四川 成都 610041）

猪流行性腹泻（PED）由冠状病毒科Alpha 冠状病毒属的猪流行性腹泻病毒（PEDV）引起，PEDV 对各日龄猪都具有易感性，对2 周龄内仔猪的致死率可达100%［1］。PEDV 为单股正链RNA 病毒，全基因组序列大小约为28 kb，包含5′端帽子结构，3′端poly（A）尾及7 个开放阅读框（ORF），共编码纤突蛋白（S蛋白）、包膜蛋白（E蛋白）、膜蛋白（M蛋白）和核衣壳蛋白（N蛋白）等四种结构蛋白，以及ORF1ab 复制酶多聚蛋白和ORF3蛋白等非结构蛋白［2］。S蛋白是PEDV重要的毒力蛋白，它所构建的系统进化树可将PEDV划分为G1和G2两个型，其中G2型包含G2a、G2b和G2c 亚型［3］，我国目前流行的毒株主要是G2a、G2b 亚型。监测S 基因的遗传变异对PED 的防控施策具有重要意义［4］。此外，PEDV的ORF3蛋白是唯一的非结构辅助蛋白。在PEDV连续传代弱化毒株中，ORF3 基因存在17 个连续氨基酸的稳定缺失，可能与其毒力弱化有关［5］。E 蛋白主要调控病毒组装、胞内运输和病毒释放等过程，还能引起内质网产生应激，并促使宿主细胞产生白细胞介素-8（IL-8）、B-细胞淋巴瘤/白血病-2基因（Bcl-2），造成细胞损伤和诱导细胞凋亡［6］。M 蛋白位于整个细胞质中，通过与S 蛋白和N 蛋白相互作用在病毒核衣壳的组装过程中发挥重要作用，对细胞增殖和病毒复制具有重要影响。N蛋白是一种高度保守的磷蛋白［7］，是PEDV核衣壳的基础结构，在病毒复制、组装过程中发挥重要作用。

本研究对四川省雅安地区流行的一株PEDV SCYA2204的S基因、ORF3基因、E基因、M基因和N基因进行基因克隆及测序，分析病毒基因核苷酸序列，并推导氨基酸序列的变异性及遗传进化特征，以期为PEDV 的有效防控提供理论依据。……