TMEM64在肝癌组织中高表达并促进肝癌细胞的增殖和侵袭
2023-09-13曹丹萍蔡娟李艳娜董润雨王智雄左学良
南方医科大学学报 2023年8期
曹丹萍,蔡娟,李艳娜,董润雨,王智雄,左学良
皖南医学院第一附属医院//弋矶山医院1胃肠外科,2肿瘤内科,安徽 芜湖241001
肝癌是全球范围内发病率第6和死亡率第3的恶性肿瘤,我国更是肝癌的高发地区[1,2]。根据2022年我国癌症中心的最新数据,肝癌在恶性肿瘤中的发病率位于第5,死亡率位于第2,5年生存率仅为14.1%[3]。大多数肝癌患者早期无症状,确诊时已处于中晚期,失去最佳手术机会[4,5]。肝癌患者手术后复发率仍然较高,预后极差[6]。挖掘新的诊断标志物和预后预测指标对肝癌患者早期发现,制定个体化治疗方案具有重要临床研究价值。
跨膜蛋白(TMEMs)是一类能够多次跨越细胞膜并参与调控细胞间信号交流和传递的蛋白家族,人类的许多疾病的发生和进展都与跨膜蛋白的功能异常有关[7]。目前,已发现较多的TMEMs在恶性肿瘤中表达失调[8-10],参与调控肿瘤侵袭转移相关通路[11-13]。TMEM64是一个位于8号染色体上的编码基因,属于跨膜蛋白家族的成员。目前对于TMEM64的研究较少,TMEM64在肝癌中的功能未见报道,有待进一步探索。
本研究通过分析癌症基因组图谱(TCGA)和基因型组织表达项目(GTEx)数据库中TMEM64在肝癌中的表达情况和预后预测价值,探究TMEM64对肝癌细胞增殖和侵袭的影响,为肝癌治疗提供新的分子靶标。
1 材料和方法
1.1 数据库分析
从TCGA数据库(n=377)和GTEx数据库中收集了肝癌患者的mRNA 表达谱和临床数据。3 级HTSeq FPKM 格式数据标准化为每百万次读取的转录本(TPM)。使用UCSC Xena3数据库和GTEx数据库中获得TPM格式的RNA测序数据进行分析。……
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