浆液性卵巢癌患者的斯钙素2表达水平及其与预后的关系
2023-08-21吴文娟陈历排张东辉高春辉
吴文娟,陈历排,张东辉,高春辉
广州医科大学附属肿瘤医院妇科肿瘤外科1、病理科2、重症医学科3,广东 广州 510095
根据2020年癌症统计,全世界每年约有313 959例卵巢癌新发病例和207 252 例卵巢癌相关的死亡病例[1]。卵巢上皮性肿瘤为最常见的卵巢肿瘤,多数确诊时已是晚期,转移及复发率高,因此卵巢癌治疗仍存在巨大挑战[2]。斯钙素2 (Stanniocalcin 2,STC2)属于高度保守的分泌型糖蛋白激素家族。人类的STC2是由302个氨基酸组成,广泛表达于肾、卵巢、骨、神经及肌肉等组织中,并具有广泛的促瘤作用[3]。本文基于公共数据库TCGA及GTEx的转录组数据,对STC2在泛癌中的差异表达、预后意义进行了分析,进而在高级别浆液性卵巢癌及正常卵巢组织中,采用免疫组化检测STC2的表达,并且分析STC2的表达水平与患者预后的相关性,为后续的分子及机制的研究提供临床基础。
1 材料与方法
1.1 泛癌中的STC2 数据来源于TCGA (The Cancer Genome Atlas,癌症基因组图谱)及GTEx(Genotype Tissue Expression)数据库中level3 HTSeq-FPKM格式的RNAseq 数据,将其转成TPM 格式并进行log2转化。统计分析及可视化主要使用的是R(3.6.3版本)软件的ggplot2(3.3.3 版本)。本文分析了STC2 在TCGA 的肿瘤组织及对应的GTEx 正常组织中的差异表达。Tumor Immune Estimation Resource(TIMER,http://timer.comp-genomics.org/)可用于分析泛癌中的免疫浸润情况,包括TCGA数据中的32种癌症10 897例样本的基因表达、临床预后、体系突变、体细胞拷贝数的改变以及肿瘤免疫系统的特征[4]。采用TIMER 2.0在线分析了STC2 在泛癌中的免疫浸润情况。基于TCGA 的临床信息,分组为0~50vs50~100,使用R 语言的survival 包(3.2~10 版本)用于生存资料的统计分析;survminer 包(0.4.9 版本)用于可视化。分析STC2在泛癌中的预后意义。
1.2 材料与……
