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P3H家族基因在膀胱尿路上皮细胞癌组织中的表达及其预后意义

2021-12-14陈炎锋何孝永

浙江医学 2021年22期
关键词:水平

陈炎锋 何孝永

膀胱尿路上皮细胞癌(bladder urothelial carcinoma,BLCA)是最常见的恶性肿瘤之一,具有较高的复发率和死亡率[1]。目前虽有大量研究对BLCA的发生、发展和转移机制等作了探讨,但是对BLCA的分子特征仍然未知。笔者认为,筛选鉴定BLCA相关肿瘤标志物并探究相关机制,将有助于发现新的治疗方案。脯氨酰3-羟化酶(prolyl 3-hydroxylase,P3H)主要包括 P3H1、P3H2、P3H3、P3H4、CRTAP,其中P3H4已被证实与泌尿系肿瘤相关[2]。目前关于不同P3H家族基因在BLCA的发生、发展中的具体作用尚未知晓。因此,本研究对不同P3H家族基因在BLCA组织中的表达及其预后意义作一探讨,以期为BLCA的临床诊治提供参考。

1 对象和方法

1.1 对象 从癌症基因组图谱数据库(https://portal.gdc.cancer.gov/)和GTEx数据库获取435例BLCA患者的临床数据,其中男309例,女126例;年龄69(60,77)岁;肿瘤TNM分期:Ⅰ期25例,Ⅱ期130例,Ⅲ期142例,Ⅳ期138例。

1.2 数据获取 (1)BLCA与癌旁正常组织中P3H家族基因表达水平的数据:使用UCSC XENA(https://xenabrowser.net/datapages/)经Toil流程统一处理的TPM格式的RNAseq数据并进行log2转化后获得。(2)临床相关性及预后分析数据:将数据库中HTSeq-FPKM格式的RNAseq数据转换成TPM格式,并进行log2转化后获得。

1.3 统计学处理 采用R 3.6.3统计软件。不符合正态分布的计量资料组间比较采用Kruskal-Wallis H检验。以P3H家族基因表达水平的中位数为分界点分为高、低表达组,绘制Kaplan-Meier生存曲线并采用log-rank检验比较两组总体生存率。绘制ROC曲线分析P3H家族基因表达水平预测患者预后的效能,AUC为0.5~<0.7提示有较低的准确度,0.7~0.9提示有一定的准确度,>0.9提示有较高的准确度。P<0.05为差异有统计学意义。

2 结果

2.1 BLCA与癌旁正常组织中P3H家族基因表达水平比较 与癌旁正常组织比较,P3H1、P3H4在BLCA组织中的表达水平均明显升高,P3H2、P3H3、CRTAP在BLCA组织中的表达水平均明显降低,差异均有统计学意义(均 P<0.05),见图 1(插页)。……

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