APP下载

广东省东莞地区汉族人群20个STR基因座多态性及与22个群体FST遗传距离的分析

2021-12-02李雪蕾袁健彪林汉光

中国保健营养 2021年31期

李雪蕾 袁健彪 林汉光

1.广东正航司法鉴定中心,广东 东莞 523000;2.东莞市公安局大岭山分局,广东 东莞 523000;3.广东医科大学 ,广东 东莞 523000

人类的遗传与变异使每一个体的遗传信息与他的亲代、子代具有相似性,但每一个体又具备自身的遗传特征。将这些遗传学参数进行调查、统计、分析,为该地区的汉族人群的相关研究和司法鉴定提供基础数据。

1 材料与方法

1.1样本 1681例无关个体的样本为广东正航司法鉴定中心的2019-2020年案件的样本,已征得当事人的同意,样本类型为血样或口腔拭子。

1.2设备与方法 所有样本均采用Chelex法进行DNA提取。样本中加入10% Chelex-100的混悬液 200μL, 置于eppendorf恒温混匀仪上设置56℃恒温震荡孵育30min;剧烈振荡5-10sec,98℃加热8min; 12,000r/min离心3 min。取上清液用PowerPlex© 21 System人类荧光标记STR复合扩增检测试剂(Promega公司)进行复合PCR扩增。用ABI3100遗传分析仪(ABI公司)进行毛细管电泳和基因型分析。

1.3统计学分析 采用Arlequin v3.5、Powerstates软件计算各基因座的随机匹配概率(Pm)、个体识别率(DP)、多态性信息含量(PIC)、非父排除率(PE)、杂合度(He)、哈温平衡P值(HWE-P)、遗传距离矩阵。

2 结 果

2.1东莞地区汉族人群的STR基因座遗传多态性及法医遗传学参数 用上述方法对1681位来自广东东莞地区的汉族无关个体,进行20个常染色体STR基因座分析(含D3S1358、D1S1656、D6S1043、D13S317、Penta E、D16S539、D18S51、D2S1338、CSF1PO、Penta D、TH01、vWA、D21S11、D7S820、D5S818、TPOX、D8S1179、D12S391、D19S433、FGA),获得等位基因频率分布、随机匹配概率(Pm)、个体识别率(DP)、多态性信息含量(PIC)、非父排除率(PE)、杂合度(He)、哈温平衡P值(HWE-P)、FST遗传距离矩阵等参数(表1)。

表1 东莞地区汉族人群20个STR基因座的法医遗传学参数

2.2东莞地区汉族人群与22个群体FST遗传距离分析(表2)

表2 本群体与22个群体FST遗传距离矩阵各群体FST遗传距离

登录APP查看全文