罗 越，胡洋洋，张 兴，王亚东，赵彩彦

(河北医科大学第三医院感染科，河北 石家庄 050051)

病原学诊断作为感染性疾病诊断最重要的环节之一，对感染性疾病精准诊疗的价值毋庸置疑，但传统的病原学检测技术存在检测周期长、阳性率低、受抗生素使用影响，特殊病原体难于检测等影响，不能满足当前临床快速、精准的病原学诊断，继而有的放矢的指导目标治疗的需求。宏基因组二代测序技术(metagenomics next generation sequencing,mNGS)简称二代测序，以其无偏倚、广覆盖、高通量、快速精准等优势，逐渐被临床所重视和认可。自2014年mNGS被首次用于脑脊液检测钩端螺旋体感染的病例后，国内外mNGS相关研究和文献报道越来越多，并逐渐在临床诊断实践中推广、普及。mNGS检测包括采集感染部位样本、提取核酸、制备文库，以及高通量测序、分析生物信息、解读检测报告等关键环节。作为一项新的生物检测技术，在临床应用过程中需要规范应用范围和诊断标准，优化检测流程与质量控制等环节，以最大限度提升其临床应用价值。《中国宏基因组学第二代测序技术检测感染病原体的临床应用专家共识》[1]，是针对感染病原体宏基因组学检测的第一部中国标准规范，于2020年11月由《中华传染病杂志》编辑委员会发布，重点总结mNGS检测技术在临床应用范围、样本采集规范、科学报告解读和诊断效能评估等方面，并制定推荐意见。笔者以临床角度从mNGS的适用范围与诊断效能、样本采集与运输质量控制、结果判读与验证等方面分别进行解读，以期加深临床医师对共识的认知和理解，全方位提升mNGS的临床应用与诊断效能。……