范阿慧 张瑞 周金池 何阳菘 樊代明 赵晓迪 卢瑗瑗

肝癌是全球第六大恶性肿瘤，也是第四大癌症相关死亡原因［1］。肝细胞癌（hepatocellular carcinoma，HCC）约占原发性肝癌的90%，尽管近年来HCC的治疗手段有了显著改善，但发病率和死亡率仍较高［2］。因此，HCC患者的早期诊断和预后预测至关重要。传统观念认为增强子通过招募转录因子进而调控靶基因转录水平。最近发现大多数活性增强子可以转录为eRNA，并在肿瘤发生发展过程中发挥作用［3］。研究表明eRNA异常表达与癌基因［4］、肿瘤抑制基因［5］失调以及细胞对外部信号的异常反应有关，如激素［6］、炎症［7］、缺氧［8］，因此 eRNA有可能是潜在的诊断标志物及治疗靶点。本研究根据HCC患者预后信息以及与预测靶基因表达相关性筛选出的eRNA构建预后模型，同时对预后相关eRNA进行临床参数相关性分析和富集分析，以期为HCC的诊断和预后评估提供新的方向。

1 资材料与方法

1.1 数据获取

利用PreSTIGE算法，获得eRNA以及预测靶基因列表［9⁃10］，并使用 EnsemblBioMart将转录本 ID 转化为基因 Symbol。从 TCGA 数据库（https：//portal.gdc.cancer.gov）收集374例HCC患者的基因序列和临床数据。

1.2 筛选与HCC预后相关的eRNA

使用交互式网络服务器TANRIC（癌症中非编码RNA图谱）对TCGA数据库中的HCC队列中eRNA的水平及其与临床的相关性进行研究。使用中位数法将TCGA数据库中的HCC患者分为高表达组和低表达组。使用TANRIC共表达数据评估eRNA水平与其预测目标基因之间的相关性。与总生存期（overall survival，OS）（Log⁃rankP＜0.05）及其靶基因水平（r＞0.5，P＜0.001）相关的 eRNA，被认为是HCC中的候选关键eRNA。

1.3 预后模型的构建与评价

通过Lasso回归分析获得候选eRNA的表达数据。……