肝癌细胞来源的外泌体作用正常肝细胞后差异表达环状RNA的筛选*
2021-11-20沈彩红黄文杰沈永奇卢永刚孙一帆
沈彩红,孙 林,黄文杰,沈永奇,卢永刚,孙一帆△
(广西医科大学附属柳铁中心医院:1.感染科;2.检验科;3.肿瘤科;4.肝胆外科,广西柳州 545007)
肝癌是常见的恶性肿瘤之一,其在肿瘤中的发病率位列第4,病死率位列第3[1]。肝癌具有较高的发病率和病死率,急切需要有效的早期诊断。目前,肝癌早期诊断较为理想的血清标志物为甲胎蛋白,但由于其特异度不高,故亟待探索其他有助于肝癌早期有效诊断的生物标志物。近年来,外泌体在肿瘤疾病中的作用已成为研究热点之一。外泌体中含大量核酸、蛋白、脂质等物质,参与了细胞之间或细胞与组织间的通讯,影响肿瘤的发生、发展。环状RNA(circRNA)作为外泌体内含物中的一种核酸,随着RNA测序技术的迅速发展,大量circRNA被发现与肿瘤的发生存在潜在的关联,发挥了重要的调控作用,具有巨大潜力,因此,其有可能成为肝癌早期筛查的一种新型生物标志物[2]。本研究通过对肝癌HepG2细胞外泌体与正常肝细胞LO2共同培养后circRNA表达进行比较,筛选验证了具有差异表达的circRNA,并预测分析了其在肝癌发展的作用,现报道如下。
1 材料与方法
1.1 试剂与仪器
外泌体提取试剂盒(美国Thermo公司)、总RNA提取试剂盒(美国Qiagen公司)、Trizol试剂(美国Invitrogen公司)、Arraystar Super RNA Labeling Kit(美国Arraystar公司)、Arraystar Human circRNA Arrays V2(美国Arraystar公司)、SYBRGreen 聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)试剂盒(美国Thermo公司)、逆转录试剂盒(美国Thermo公司)、AB7500荧光定量PCR仪(美国Applied Biosystems公司)、低温冷冻离心机(美国Sigma公司)、Agilent Hybridization Oven、Agilent Scanner G2505C、Nanodrop ND-1000等。实时荧光定量 PCR所用引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成,序列见表1。

表1 实时荧光定量……
