乙型肝炎病毒对miR-10b表达的影响及其生物信息学分析*
2021-11-20梁俐兰刘莉莉覃超梅石明连刘永明苏何玲
梁俐兰,刘莉莉,覃超梅,梁 斌,石明连,刘永明,苏何玲
(桂林医学院生物化学与分子生物学教研室,广西桂林 541100)
乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染引起的急、慢性肝炎,肝硬化和肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是全球性的主要卫生问题。全球慢性乙型肝炎患者约2.57亿人,每年约887 000人死于HBV感染导致的肝硬化和HCC。近年来,HBV引起的宿主微小RNA(micro RNA,miRNA)表达变化及其在肝脏疾病发生、发展中的作用已成为HBV感染相关疾病发病机制研究的热点[1-2]。miRNA是一类长度为19~25个核苷酸的非编码单链小分子RNA,可通过与靶基因mRNA的3′非翻译区部分序列同源性结合而诱导基因沉默,在基因表达调控中发挥着重要作用。有研究表明,miRNA可影响HBV在宿主细胞内的复制和基因表达,而HBV则可通过调节宿主miRNA表达为其提供生存与复制的有利环境[3-6]。这种miRNA介导的HBV与宿主的相互关系是HBV感染相关疾病发病机制的重要基础。
miR-10b是新近被发现与多种疾病的发生、发展密切相关的一种疾病相关性miRNA,在一些病毒性疾病的发病机制中具有关键作用[7-9]。本研究分析美国生物技术信息中心(national Center for Biotechnology Information,NCBI)基因表达综合数据库中的GSE19980和GSE121248数据发现,miR-10b在稳定表达HBV的HepG2.2.15细胞中表达明显上调。进而提取HepG2.2.15细胞及其对照HepG2细胞的总RNA进行荧光定量聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)检测,证实了HBV对miR-10b表达的上调作用。在此基础上,对HBV上调miR-10b表达在肝脏疾病中的作用进行生物信息学分析,以期为研究miR-10b在HBV感染及其致病机制中的作用提供理论与实验依据。
1 材料与方法
1.1 实验材料
人肝癌细胞HepG2细胞株及稳定表达HBV的HepG2.2.15细胞均购自上海中国科学院细胞库。……
